More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2799 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  83.75 
 
 		 488 aa  857    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 485 aa  1000    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  81.78 
 
 		 484 aa  838    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  84.68 
 
 		 484 aa  853    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 		 493 aa  529  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 509 aa  522  1e-147  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 493 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 505 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 493 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 493 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 493 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 493 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 494 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 494 aa  512  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 493 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 493 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 509 aa  511  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 493 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 503 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 493 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 494 aa  478  1e-133  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 506 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 504 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 504 aa  391  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 500 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 492 aa  374  1e-102  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 479 aa  373  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 476 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 492 aa  365  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 480 aa  362  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 484 aa  359  7e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 487 aa  358  9e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 486 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 480 aa  350  4e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 491 aa  349  5e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 493 aa  349  6e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 477 aa  346  6e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 482 aa  338  9e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.18 
 
 		 495 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 504 aa  336  5e-91  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 496 aa  333  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 479 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 490 aa  332  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 488 aa  332  9e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 502 aa  332  1e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 502 aa  330  3e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 506 aa  330  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 490 aa  329  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 		 502 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 502 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 485 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 503 aa  326  5e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 498 aa  323  3e-87  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 485 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 503 aa  323  3e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 485 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 480 aa  319  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 464 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 510 aa  317  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 464 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 503 aa  317  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 501 aa  316  6e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 469 aa  316  6e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 535 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 516 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 469 aa  310  5e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 500 aa  308  2.0000000000000002e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 501 aa  307  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 494 aa  306  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 488 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 511 aa  305  2.0000000000000002e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 504 aa  304  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 504 aa  302  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 495 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 481 aa  300  3e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 485 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>