More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2659 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2659  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 517 aa  1066    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 490 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 494 aa  342  7e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.88 
 
 		 495 aa  336  5.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 		 501 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 479 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 496 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 495 aa  319  9e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 504 aa  315  9e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  34.82 
 
 		 491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 495 aa  311  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 484 aa  309  9e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  34.17 
 
 		 492 aa  306  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 493 aa  302  8.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 484 aa  302  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 487 aa  299  7e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 480 aa  299  7e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 482 aa  299  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 490 aa  298  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 488 aa  297  3e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 477 aa  296  5e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 485 aa  294  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 471 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 		 498 aa  293  7e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 469 aa  292  9e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 469 aa  292  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 492 aa  290  5.0000000000000004e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 		 506 aa  290  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 512 aa  290  6e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 507 aa  289  7e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 		 486 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 509 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 503 aa  288  2e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  32.69 
 
 		 492 aa  288  2e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 509 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  35.18 
 
 		 475 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 535 aa  287  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 516 aa  286  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 473 aa  286  8e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  33.84 
 
 		 491 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 511 aa  285  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 473 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 494 aa  283  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  32.49 
 
 		 501 aa  283  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 474 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 491 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 463 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 496 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 489 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 505 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 474 aa  281  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 475 aa  281  3e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 501 aa  280  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 475 aa  280  6e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 517 aa  279  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 510 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  33.4 
 
 		 481 aa  279  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  32.3 
 
 		 485 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 490 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 488 aa  277  3e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 509 aa  277  4e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 496 aa  276  7e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  30.84 
 
 		 490 aa  276  8e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 514 aa  276  9e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  33.79 
 
 		 473 aa  276  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 		 474 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 490 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1888  glutamyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  33.85 
 
 		 488 aa  275  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 471 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 		 494 aa  275  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  35.12 
 
 		 491 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 490 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 492 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  35.23 
 
 		 501 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  35.01 
 
 		 473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 464 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  33.46 
 
 		 466 aa  273  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 493 aa  273  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  32.88 
 
 		 485 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  32.75 
 
 		 502 aa  273  8.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  32.36 
 
 		 478 aa  273  8.000000000000001e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  32.77 
 
 		 505 aa  272  9e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 470 aa  272  1e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  32.68 
 
 		 480 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 504 aa  272  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 467 aa  271  2e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 473 aa  271  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>