More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4251 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 502 aa  1035    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 		 510 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 505 aa  523  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 512 aa  518  1.0000000000000001e-145  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 516 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 		 501 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 509 aa  494  9.999999999999999e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 500 aa  493  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 517 aa  489  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 511 aa  485  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 502 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 503 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.6 
 
 		 495 aa  336  5.999999999999999e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 492 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 487 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 484 aa  329  9e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 484 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 494 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 486 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 479 aa  322  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 491 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 493 aa  320  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 504 aa  320  5e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 489 aa  319  9e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 		 493 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 490 aa  317  4e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 492 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 		 490 aa  312  7.999999999999999e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 505 aa  311  2e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 503 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 		 480 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 489 aa  307  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 479 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 503 aa  306  5.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 490 aa  306  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 		 506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 509 aa  303  5.000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  35.81 
 
 		 491 aa  302  8.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 488 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 		 465 aa  299  9e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 490 aa  297  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 		 480 aa  296  4e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 		 469 aa  295  9e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.47 
 
 		 546 aa  295  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 494 aa  293  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 509 aa  293  5e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 484 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 485 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 485 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 493 aa  292  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 485 aa  291  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 506 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 488 aa  290  4e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 507 aa  289  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 493 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 466 aa  289  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  34.12 
 
 		 482 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 504 aa  286  5.999999999999999e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 		 495 aa  286  7e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 484 aa  286  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 493 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 493 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 474 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 477 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 493 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 494 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 493 aa  284  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 474 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 474 aa  283  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 467 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 488 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  33.94 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 		 498 aa  280  3e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 469 aa  280  4e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 494 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 494 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 490 aa  279  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 483 aa  278  2e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  34.11 
 
 		 491 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 471 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 469 aa  276  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 465 aa  276  6e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 485 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>