More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0504 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
512 aa  1058    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  59.84 
 
 
517 aa  644    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 
509 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 
516 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 
510 aa  568  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 
500 aa  565  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
505 aa  558  1e-157  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 
501 aa  548  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
500 aa  543  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
502 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 
511 aa  513  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
502 aa  423  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
502 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
504 aa  415  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
502 aa  412  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 
502 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
503 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 
503 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
486 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
491 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 
492 aa  363  5.0000000000000005e-99  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
504 aa  352  8.999999999999999e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
494 aa  352  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
493 aa  350  5e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
506 aa  349  7e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 
488 aa  348  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
507 aa  347  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
505 aa  346  7e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
495 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  39.14 
 
 
495 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
503 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
484 aa  343  5e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
506 aa  342  7e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
490 aa  342  8e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
493 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
487 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 
509 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
489 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
501 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  38.42 
 
 
493 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
490 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
493 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
493 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
485 aa  334  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
476 aa  334  2e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
492 aa  333  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
479 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
514 aa  333  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
489 aa  333  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
490 aa  331  2e-89  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
485 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
480 aa  330  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
490 aa  329  8e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
509 aa  329  8e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
467 aa  326  6e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
479 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
494 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
465 aa  323  4e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
494 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
506 aa  322  7e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  35.26 
 
 
466 aa  323  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
491 aa  322  9.000000000000001e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
469 aa  320  5e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 
480 aa  320  5e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
491 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
485 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
467 aa  317  3e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
469 aa  317  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
496 aa  317  5e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
493 aa  316  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
503 aa  316  6e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
490 aa  316  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
469 aa  314  2.9999999999999996e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 
485 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
491 aa  312  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
477 aa  312  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
488 aa  312  1e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
485 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
485 aa  311  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
485 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
485 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
485 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
499 aa  311  2.9999999999999997e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
484 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
504 aa  309  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
493 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>