More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0243 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
510 aa  1067    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  62.5 
 
 
502 aa  664    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 
516 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 
512 aa  568  1e-161  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 
505 aa  561  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
509 aa  554  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 
500 aa  548  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 
517 aa  545  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
501 aa  537  1e-151  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
500 aa  536  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
511 aa  512  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
504 aa  420  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 
502 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
502 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
502 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  41.35 
 
 
503 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
502 aa  411  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
503 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
494 aa  372  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
487 aa  362  1e-98  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
484 aa  356  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
479 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
484 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
486 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.93 
 
 
495 aa  352  7e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
493 aa  351  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
503 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
504 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
490 aa  343  4e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
492 aa  343  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
490 aa  343  4e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
490 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
501 aa  338  9e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
509 aa  339  9e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
491 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
509 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
477 aa  336  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 
506 aa  336  5.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
507 aa  336  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
505 aa  335  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
493 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
504 aa  333  6e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
495 aa  332  7.000000000000001e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
469 aa  331  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
489 aa  330  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 
469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
485 aa  326  5e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
476 aa  323  4e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
479 aa  323  6e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
485 aa  322  8e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 
491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
482 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
467 aa  318  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
465 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
485 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
493 aa  318  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
485 aa  317  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
490 aa  317  3e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
466 aa  317  4e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
506 aa  316  6e-85  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
488 aa  316  7e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.52 
 
 
546 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
493 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
493 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
493 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
514 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
493 aa  312  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
494 aa  312  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  36.08 
 
 
480 aa  312  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
484 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
484 aa  309  8e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
489 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
504 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  34.46 
 
 
467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
488 aa  306  8.000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
488 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
493 aa  303  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
465 aa  303  6.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 
503 aa  303  6.000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
495 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 
472 aa  301  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
490 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
469 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
490 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  34.28 
 
 
504 aa  300  5e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  33.86 
 
 
467 aa  300  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
490 aa  300  6e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
494 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
494 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 
473 aa  298  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>