More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1211 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 493 aa  635    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  61.73 
 
 		 514 aa  641    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  67.34 
 
 		 503 aa  703    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 494 aa  1021    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  66.94 
 
 		 493 aa  701    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 		 493 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  67.81 
 
 		 493 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 493 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  60.7 
 
 		 493 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 493 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  61.11 
 
 		 493 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 494 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 494 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  60.85 
 
 		 493 aa  623  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 		 493 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  60.3 
 
 		 505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 509 aa  597  1e-169  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 		 509 aa  597  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 485 aa  478  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 506 aa  473  1e-132  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 484 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 484 aa  465  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 489 aa  459  9.999999999999999e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 476 aa  424  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 479 aa  414  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 492 aa  403  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 504 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 504 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 500 aa  382  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 506 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 492 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 480 aa  341  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 502 aa  339  7e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 482 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 490 aa  337  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.66 
 
 		 495 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 502 aa  334  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 487 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 504 aa  331  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 502 aa  330  4e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 516 aa  330  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 495 aa  326  5e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 502 aa  326  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 503 aa  325  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 489 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 479 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 484 aa  325  2e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 507 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 506 aa  318  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 488 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 503 aa  316  8e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 500 aa  315  8e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 464 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 470 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 470 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 512 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 509 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 517 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 486 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  35 
 
 		 485 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 510 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 496 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 505 aa  308  2.0000000000000002e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 475 aa  307  3e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 469 aa  306  6e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 511 aa  303  6.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 473 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 475 aa  302  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 494 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 491 aa  301  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 491 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  36.23 
 
 		 546 aa  297  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 463 aa  297  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 490 aa  295  9e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>