More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1566 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
505 aa  1034    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 
501 aa  597  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  56.65 
 
 
500 aa  588  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 
509 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 
516 aa  587  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  51.87 
 
 
510 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  53.05 
 
 
517 aa  556  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  51.77 
 
 
512 aa  558  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 
511 aa  548  1e-155  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 
502 aa  523  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 
500 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
502 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
503 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
502 aa  390  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
503 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
502 aa  388  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
502 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
494 aa  362  1e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  41.07 
 
 
495 aa  360  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
490 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
486 aa  350  3e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
490 aa  344  2.9999999999999997e-93  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
495 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
501 aa  340  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
503 aa  336  5.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
492 aa  335  1e-90  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
491 aa  333  4e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
477 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
480 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
485 aa  332  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
490 aa  329  7e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.42 
 
 
485 aa  329  8e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 
492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
479 aa  327  3e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
488 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
487 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
479 aa  326  5e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
484 aa  325  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
503 aa  323  4e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
482 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
484 aa  322  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
507 aa  320  3e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
506 aa  320  3.9999999999999996e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
466 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 
491 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
506 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
493 aa  317  4e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
476 aa  315  9e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
514 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
504 aa  315  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 
493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
485 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 
505 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
491 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
465 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
485 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
485 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
485 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
485 aa  310  4e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
485 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
485 aa  310  5e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
488 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 
467 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
493 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
489 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
491 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
494 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  35.8 
 
 
484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 
499 aa  306  5.0000000000000004e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
472 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
493 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
489 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 
494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
466 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
504 aa  303  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
493 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
484 aa  303  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 
484 aa  303  6.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
494 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
493 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
467 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 
495 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  35.87 
 
 
509 aa  299  7e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
504 aa  299  9e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
469 aa  298  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  35.55 
 
 
509 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
493 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>