More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1891 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  65.84 
 
 
494 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  64.43 
 
 
493 aa  678    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  64.43 
 
 
493 aa  670    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  64.23 
 
 
493 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 
493 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  64.02 
 
 
514 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  64.23 
 
 
493 aa  672    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  65.72 
 
 
503 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  67.81 
 
 
494 aa  712    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  63.14 
 
 
493 aa  647    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  66.05 
 
 
494 aa  671    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  64.43 
 
 
493 aa  676    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  68.57 
 
 
493 aa  704    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
493 aa  1029    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  64.84 
 
 
493 aa  680    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 
509 aa  619  1e-176  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  62.42 
 
 
505 aa  620  1e-176  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 
509 aa  615  1e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
488 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
485 aa  491  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 
484 aa  484  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 
489 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 
506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 
492 aa  421  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
476 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  45.66 
 
 
480 aa  412  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  55 
 
 
504 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
504 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
500 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
479 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
506 aa  370  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
516 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
492 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
502 aa  355  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
517 aa  353  4e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
484 aa  349  5e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 
490 aa  348  2e-94  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
482 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
512 aa  342  8e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
487 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
503 aa  336  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
509 aa  336  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
502 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
504 aa  335  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
500 aa  335  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
507 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
510 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 
502 aa  334  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
503 aa  332  7.000000000000001e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 
502 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
477 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
484 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.53 
 
 
495 aa  330  4e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.68 
 
 
480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
506 aa  326  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
494 aa  325  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  39.1 
 
 
546 aa  323  3e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
479 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
494 aa  323  4e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 
489 aa  322  9.000000000000001e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
511 aa  322  9.999999999999999e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
490 aa  321  1.9999999999999998e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
491 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
485 aa  320  5e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 
495 aa  320  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
488 aa  319  6e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
486 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
505 aa  317  3e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
495 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
493 aa  317  4e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
503 aa  317  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
485 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
501 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
501 aa  313  5.999999999999999e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
496 aa  312  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
488 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
494 aa  306  6e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
464 aa  306  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
493 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
465 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
491 aa  305  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
485 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
470 aa  303  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 
467 aa  302  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 
467 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
471 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
470 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
466 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 
504 aa  299  6e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
469 aa  300  6e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
478 aa  299  7e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
464 aa  299  8e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 
473 aa  298  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 
490 aa  297  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
469 aa  296  4e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>