More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1006 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
501 aa  1028    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  64.19 
 
 
500 aa  676    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  63.01 
 
 
511 aa  659    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 
505 aa  597  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 
512 aa  548  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
509 aa  541  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
510 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 
516 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  50.69 
 
 
517 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
502 aa  506  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
500 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
504 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
503 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 
502 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
502 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
502 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 
503 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
502 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
476 aa  365  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 
486 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
490 aa  353  5.9999999999999994e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
479 aa  352  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 
494 aa  350  4e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
492 aa  346  5e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.27 
 
 
495 aa  346  5e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 
491 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 
501 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
487 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
484 aa  343  4e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
495 aa  342  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
506 aa  340  4e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
480 aa  340  5e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
491 aa  339  9e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
480 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
492 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
484 aa  335  1e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
504 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 
493 aa  333  5e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
489 aa  333  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
479 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
514 aa  332  9e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
488 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 
503 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
482 aa  329  6e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
491 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
467 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
490 aa  325  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
490 aa  325  2e-87  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
485 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
484 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
484 aa  325  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
493 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
493 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
485 aa  323  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
506 aa  323  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
483 aa  322  7e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
493 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
465 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
467 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 
505 aa  320  3e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
472 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
496 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
490 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
493 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
494 aa  320  5e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
484 aa  319  6e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
489 aa  319  6e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
467 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 
493 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
509 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
485 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
485 aa  316  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
485 aa  316  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
485 aa  316  8e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
485 aa  316  8e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
485 aa  316  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
499 aa  315  8e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
485 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
506 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
466 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
466 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
493 aa  313  5.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
485 aa  313  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
484 aa  312  7.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
491 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 
493 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  35.2 
 
 
495 aa  309  8e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.6 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
485 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>