More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0392 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  74.75 
 
 		 503 aa  810    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  74.19 
 
 		 503 aa  791    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  80.68 
 
 		 502 aa  862    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  80.48 
 
 		 504 aa  863    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 502 aa  1036    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  79.4 
 
 		 502 aa  845    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  77.56 
 
 		 502 aa  830    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  51.6 
 
 		 500 aa  512  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 512 aa  419  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 486 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 516 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 511 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 490 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 517 aa  393  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 505 aa  390  1e-107  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 500 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 477 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 489 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 479 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 501 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  40.04 
 
 		 495 aa  382  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 509 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 484 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 482 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 490 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 487 aa  365  1e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 491 aa  365  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 496 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 479 aa  363  4e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 466 aa  362  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 504 aa  361  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 485 aa  359  8e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 493 aa  355  7.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 465 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 480 aa  354  2e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 506 aa  353  4e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 493 aa  352  5.9999999999999994e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 490 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 485 aa  351  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 467 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 488 aa  350  4e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 485 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 473 aa  347  3e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 504 aa  347  4e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 492 aa  347  4e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 		 514 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 509 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 469 aa  342  9e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 469 aa  341  2e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 505 aa  340  5e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 491 aa  340  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 469 aa  340  5e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 493 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 467 aa  339  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 494 aa  339  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 494 aa  339  8e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 467 aa  339  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 493 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 464 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 493 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 484 aa  336  5e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 		 493 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 		 468 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 490 aa  334  3e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 485 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 483 aa  333  5e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 		 485 aa  332  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 481 aa  332  1e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 503 aa  331  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 485 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 491 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 485 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 485 aa  329  7e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 485 aa  329  7e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 485 aa  329  7e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 485 aa  329  7e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 491 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 488 aa  326  7e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.85 
 
 		 466 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 484 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>