More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1888 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1888  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 433 aa  895    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2646  glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 460 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0512639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 472 aa  333  4e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 465 aa  328  9e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 466 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 488 aa  326  5e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 480 aa  325  7e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 471 aa  320  3.9999999999999996e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 465 aa  319  7e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 490 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 467 aa  317  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 495 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 488 aa  316  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 474 aa  315  9e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 477 aa  315  9e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1080  glutamyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  40.13 
 
 		 464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 475 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 500 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 470 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 		 471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 469 aa  310  4e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 485 aa  310  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 469 aa  310  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 467 aa  309  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 469 aa  309  6.999999999999999e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 493 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 468 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 464 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 471 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 487 aa  302  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 481 aa  302  9e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 509 aa  302  9e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 493 aa  301  2e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 469 aa  300  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 469 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 492 aa  300  4e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 469 aa  299  5e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 473 aa  299  7e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2734  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 482 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  35.91 
 
 		 495 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 463 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 488 aa  296  3e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 492 aa  296  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  296  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 470 aa  295  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 468 aa  295  9e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  295  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  37.26 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 478 aa  295  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 470 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 482 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 471 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 473 aa  295  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 467 aa  293  3e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 		 469 aa  293  3e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 476 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 470 aa  292  7e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  34.99 
 
 		 481 aa  292  7e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 484 aa  292  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 464 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>