163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0378 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 331 aa  683    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  47.77 
 
 		 351 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  46.31 
 
 		 344 aa  318  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  43.57 
 
 		 355 aa  314  9.999999999999999e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  43.31 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  44.35 
 
 		 341 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  44.81 
 
 		 341 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  44.86 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  45.37 
 
 		 342 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  42.56 
 
 		 341 aa  301  8.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  45.37 
 
 		 343 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  44.08 
 
 		 342 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  39.76 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  43.03 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  39.65 
 
 		 356 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  40.5 
 
 		 348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  40.3 
 
 		 340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  45.73 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  42.4 
 
 		 344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  44.34 
 
 		 330 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  44.51 
 
 		 325 aa  278  9e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.21 
 
 		 325 aa  273  3e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  39.23 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.64 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  41.74 
 
 		 325 aa  263  4e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  41.04 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  38.71 
 
 		 386 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  37.83 
 
 		 363 aa  259  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  38.53 
 
 		 363 aa  258  8e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  38.65 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  37.35 
 
 		 345 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  36.72 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  36.72 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  40.71 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  40.71 
 
 		 345 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  37.57 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  32.72 
 
 		 354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  34.53 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  34.31 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  32.44 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  35.17 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  34.93 
 
 		 348 aa  206  3e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  34.71 
 
 		 346 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  33.43 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  33.84 
 
 		 349 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  31.82 
 
 		 342 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  32.01 
 
 		 334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  32.84 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  32.62 
 
 		 334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  32.38 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  30.63 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  33.23 
 
 		 347 aa  191  1e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  33.33 
 
 		 348 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  35.05 
 
 		 349 aa  190  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  35.16 
 
 		 346 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  31.07 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  32.45 
 
 		 349 aa  189  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  32.93 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  33.33 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  30.18 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  29.64 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  29.25 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  32.43 
 
 		 640 aa  176  5e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  31.82 
 
 		 624 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  29.79 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  34.68 
 
 		 639 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  29.43 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  28.15 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  27.2 
 
 		 368 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  26.96 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  29.91 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  29 
 
 		 631 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  29.06 
 
 		 375 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  28.53 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  28.01 
 
 		 346 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  28.53 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  27.46 
 
 		 368 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  24.79 
 
 		 372 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  27.71 
 
 		 366 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  27.67 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  27.19 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  27.83 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  27.25 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  28.12 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  26.3 
 
 		 368 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  27.78 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  25.45 
 
 		 339 aa  147  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  26.76 
 
 		 374 aa  146  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  26.65 
 
 		 368 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  27.27 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  26.86 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  26.86 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  27.67 
 
 		 368 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  26.57 
 
 		 370 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  26.9 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  26.9 
 
 		 371 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  25.86 
 
 		 370 aa  142  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  26.9 
 
 		 365 aa  143  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  27.38 
 
 		 368 aa  142  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2482  agmatine deiminase  29.43 
 
 		 375 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>