160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1581 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  100 
 
 		 330 aa  689    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  49.23 
 
 		 325 aa  338  7e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  49.38 
 
 		 322 aa  332  7.000000000000001e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  50.77 
 
 		 325 aa  328  8e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  48.92 
 
 		 325 aa  324  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  47.66 
 
 		 348 aa  322  7e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  46.52 
 
 		 322 aa  322  8e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  48.31 
 
 		 325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  46.41 
 
 		 340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  49.38 
 
 		 323 aa  315  5e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  44.08 
 
 		 344 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  44.34 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  43.67 
 
 		 341 aa  296  3e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  43.03 
 
 		 351 aa  296  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  42.43 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  44.51 
 
 		 342 aa  292  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  41.12 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  43.11 
 
 		 342 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  41.79 
 
 		 341 aa  289  4e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  43.11 
 
 		 343 aa  285  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  41.44 
 
 		 376 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  39.94 
 
 		 356 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  40.29 
 
 		 355 aa  275  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  42.09 
 
 		 357 aa  275  8e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  38.81 
 
 		 367 aa  262  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  38.6 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  38.76 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  38.76 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  36.61 
 
 		 386 aa  248  8e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  37.76 
 
 		 365 aa  248  9e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  39.76 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  39.76 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  37.01 
 
 		 363 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  36.72 
 
 		 363 aa  240  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  36.12 
 
 		 345 aa  231  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  34.37 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  35.87 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  34.41 
 
 		 347 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  35.88 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  33.83 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  34.97 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  35.09 
 
 		 350 aa  202  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  33.23 
 
 		 354 aa  201  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  31.52 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  32.54 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  34.77 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  33.14 
 
 		 352 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  33.53 
 
 		 349 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  32.84 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  31.55 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  34.62 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  32.24 
 
 		 348 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  32.52 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  34.02 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  31.75 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  30.75 
 
 		 348 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  31.27 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.94 
 
 		 631 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  31.93 
 
 		 343 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  30.84 
 
 		 640 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  29.55 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  31.88 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  31.53 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  30.51 
 
 		 352 aa  179  8e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  32.23 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  30.91 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  30.82 
 
 		 639 aa  170  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  30.24 
 
 		 624 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  26.82 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  28.92 
 
 		 330 aa  165  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  29.88 
 
 		 347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  27.79 
 
 		 369 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  30.49 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  27.87 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  30.68 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  30.28 
 
 		 340 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  29.18 
 
 		 346 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  29.82 
 
 		 358 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  28.85 
 
 		 366 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  29.91 
 
 		 336 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  28.16 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  28.49 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  27.71 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  26.8 
 
 		 364 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  26.3 
 
 		 368 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  27.14 
 
 		 368 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  26.88 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  27.17 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  27.09 
 
 		 368 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  26.3 
 
 		 368 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  27.56 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  27.56 
 
 		 370 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  27.32 
 
 		 370 aa  146  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  25.66 
 
 		 339 aa  146  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  24.77 
 
 		 370 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  26.99 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  28.57 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1189  peptidyl-arginine deiminase  28.25 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  27.14 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  26.76 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>