159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1873 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  100 
 
 		 339 aa  699    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  34.78 
 
 		 341 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  33.24 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  35.59 
 
 		 356 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  35.48 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  35.48 
 
 		 350 aa  205  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  35.78 
 
 		 367 aa  205  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  34.88 
 
 		 357 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  33.82 
 
 		 344 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  34.97 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  34.31 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  35.88 
 
 		 345 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  32.55 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  31.88 
 
 		 350 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  32.55 
 
 		 343 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  32.46 
 
 		 340 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  33.43 
 
 		 351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  36.57 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  34.78 
 
 		 386 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  34.01 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  35 
 
 		 363 aa  186  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  32.56 
 
 		 343 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  32.56 
 
 		 343 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  31.76 
 
 		 341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  32.54 
 
 		 348 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  33.04 
 
 		 342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  34.12 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  31.21 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  31.63 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  30.24 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  29.79 
 
 		 331 aa  170  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  33.33 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  31.32 
 
 		 343 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  32.05 
 
 		 352 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  32.17 
 
 		 345 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  32.17 
 
 		 345 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  28.7 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  31.86 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  30.15 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  30.99 
 
 		 348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  30.54 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  27.83 
 
 		 339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  28.36 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  30.15 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  30.97 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  31.63 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  28.1 
 
 		 322 aa  159  6e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  29.55 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  31.95 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  28.86 
 
 		 640 aa  155  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  28.12 
 
 		 352 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  27.86 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  31.67 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  30.86 
 
 		 348 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  30.52 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  26.82 
 
 		 330 aa  151  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  28.82 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  28.2 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  30.09 
 
 		 631 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  28.41 
 
 		 624 aa  146  6e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  27.57 
 
 		 349 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6353  Agmatine deiminase  31.1 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.512442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  29.91 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  30 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  26.91 
 
 		 346 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  32 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  29.2 
 
 		 639 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  31.77 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  28.07 
 
 		 347 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  27.33 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  29.89 
 
 		 348 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3203  agmatine deiminase  30.17 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.659757  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  27.62 
 
 		 370 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4697  agmatine deiminase  28.07 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.399563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  27.06 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  27.46 
 
 		 346 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  27.15 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  26.87 
 
 		 370 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  26.87 
 
 		 370 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  26.67 
 
 		 370 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  26.94 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  31.13 
 
 		 346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  26.26 
 
 		 370 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  27.51 
 
 		 349 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3282  agmatine deiminase  26.26 
 
 		 370 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4756  peptidyl-arginine deiminase  26.96 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322594  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3490  agmatine deiminase  28.45 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  27 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  27 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1234  agmatine deiminase  25.97 
 
 		 370 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.792008  hitchhiker  0.00000000182454 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  27 
 
 		 365 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  25.98 
 
 		 370 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  29.57 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4759  peptidyl-arginine deiminase  31.75 
 
 		 370 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675137  normal  0.251109 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  26.63 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  27.17 
 
 		 355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  25.83 
 
 		 385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  27.71 
 
 		 369 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  25.77 
 
 		 364 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  30.99 
 
 		 374 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>