162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0531 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 
323 aa  660    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  63.86 
 
 
322 aa  424  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  64.42 
 
 
325 aa  418  1e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  61.85 
 
 
325 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  61.23 
 
 
325 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  61.23 
 
 
325 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  57.81 
 
 
348 aa  391  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  58.07 
 
 
322 aa  388  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  49.38 
 
 
330 aa  293  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  45.73 
 
 
331 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  42.99 
 
 
351 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  39.76 
 
 
341 aa  262  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  40.06 
 
 
344 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  41 
 
 
341 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  41.49 
 
 
342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  42.47 
 
 
342 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  38.87 
 
 
355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  41.21 
 
 
340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  40.96 
 
 
343 aa  252  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  40.48 
 
 
356 aa  252  7e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  41.42 
 
 
344 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  40.84 
 
 
357 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  40.18 
 
 
386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  36.7 
 
 
376 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  37.13 
 
 
367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  37.76 
 
 
350 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  37.76 
 
 
341 aa  230  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  41.3 
 
 
345 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  41.3 
 
 
345 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  37.27 
 
 
363 aa  229  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  37.16 
 
 
363 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  36.76 
 
 
345 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  35.65 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  35.65 
 
 
343 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  35.74 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  37.39 
 
 
339 aa  212  7e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  37.27 
 
 
349 aa  210  3e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  34.85 
 
 
348 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  37.81 
 
 
354 aa  203  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  35.48 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  35.24 
 
 
347 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  34.44 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  35.44 
 
 
353 aa  196  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  32.33 
 
 
348 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  34.76 
 
 
348 aa  192  8e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  35.22 
 
 
346 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  32.53 
 
 
347 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  34.93 
 
 
350 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  34.03 
 
 
352 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  32.84 
 
 
348 aa  189  7e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  33.23 
 
 
334 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  32.84 
 
 
349 aa  186  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  34.91 
 
 
365 aa  185  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  32.52 
 
 
342 aa  182  7e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  34.63 
 
 
640 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  32.27 
 
 
365 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  34.04 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  33.43 
 
 
349 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  32.24 
 
 
347 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  33.13 
 
 
349 aa  178  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  34.44 
 
 
631 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4219  Agmatine deiminase  31.9 
 
 
340 aa  172  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.292037 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  33.83 
 
 
343 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  32.82 
 
 
350 aa  170  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  33.82 
 
 
346 aa  168  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  31.12 
 
 
347 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  32.63 
 
 
624 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  32.32 
 
 
346 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  31.33 
 
 
639 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  31.04 
 
 
358 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  31.63 
 
 
339 aa  159  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  29.94 
 
 
327 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  30.49 
 
 
346 aa  156  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  27.43 
 
 
370 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  28.09 
 
 
332 aa  151  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2072  Agmatine deiminase  30.96 
 
 
364 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  28.99 
 
 
369 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  29.22 
 
 
350 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2373  twin-arginine translocation pathway signal  29.31 
 
 
372 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0189025 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  30.72 
 
 
364 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  28.7 
 
 
367 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  28.41 
 
 
367 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48450  putative peptidyl-arginine deiminase  32 
 
 
372 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000979902  normal  0.148444 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  29.19 
 
 
365 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  29.19 
 
 
371 aa  144  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  29.19 
 
 
371 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2521  agmatine deiminase  28.41 
 
 
375 aa  142  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.415458 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  28.4 
 
 
346 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  27.92 
 
 
368 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1615  agmatine deiminase  27.71 
 
 
370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  27.59 
 
 
370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0172  Agmatine deiminase  32.2 
 
 
374 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  27.51 
 
 
370 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48490  putative peptidylarginine deiminase  29.91 
 
 
346 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000276698  normal  0.151139 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  28.49 
 
 
369 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  27.51 
 
 
370 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3153  peptidyl-arginine deiminase  29.36 
 
 
330 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  27.71 
 
 
368 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  26.7 
 
 
370 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  27.22 
 
 
370 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>