159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00887 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00887  peptidyl-arginine deiminase  100 
 
 		 328 aa  664    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0609278  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  74.09 
 
 		 363 aa  511  1e-144  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  76.45 
 
 		 345 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  73.78 
 
 		 363 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  52.44 
 
 		 356 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  49.85 
 
 		 341 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  50.74 
 
 		 350 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  49.54 
 
 		 344 aa  315  5e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  49.24 
 
 		 340 aa  309  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  49.09 
 
 		 351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  47.88 
 
 		 376 aa  299  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  48.78 
 
 		 355 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  48.64 
 
 		 344 aa  295  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  48.77 
 
 		 343 aa  292  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  48.77 
 
 		 343 aa  292  5e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  48.35 
 
 		 341 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  48.33 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  47.42 
 
 		 342 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  45.43 
 
 		 367 aa  281  1e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  43.98 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  43.98 
 
 		 345 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  49.39 
 
 		 386 aa  279  5e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  44.24 
 
 		 357 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  45.76 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  47.56 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0378  peptidyl-arginine deiminase  38.65 
 
 		 331 aa  257  2e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.521894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0144  hypothetical protein  45.15 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  37.74 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3964  peptidyl-arginine deiminase  38.3 
 
 		 350 aa  222  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0085  peptidyl-arginine deiminase family protein  37.3 
 
 		 348 aa  219  5e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.360574  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.15 
 
 		 325 aa  219  7e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1581  Agmatine deiminase  34.37 
 
 		 330 aa  215  9e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.715324  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1027  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.15 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00673  peptidyl-arginine deiminase  39.58 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.027225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  35.48 
 
 		 346 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0531  peptidyl-arginine deiminase  35.74 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.709217  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0973  peptidyl-arginine deiminase family protein  33.84 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0842  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.59 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00603168  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  34.67 
 
 		 349 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  37.69 
 
 		 352 aa  207  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  40 
 
 		 342 aa  206  4e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  39.76 
 
 		 334 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  36.2 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0897  peptidyl-arginine deiminase family protein  35.42 
 
 		 325 aa  205  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  37.27 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  36.36 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  39.4 
 
 		 343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  34.77 
 
 		 368 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  34.09 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  33.23 
 
 		 352 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  34.48 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  34.24 
 
 		 639 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  35.34 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  38.65 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  31.17 
 
 		 339 aa  193  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  34.47 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  38.86 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  35.49 
 
 		 640 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  37.5 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  34.46 
 
 		 353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  37.85 
 
 		 348 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  34.63 
 
 		 365 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  34.13 
 
 		 349 aa  189  7e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  34.2 
 
 		 368 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  34.2 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  36.78 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  33.91 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  34.48 
 
 		 368 aa  186  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  32.94 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  33.33 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  33.03 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  35.63 
 
 		 372 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  33.91 
 
 		 368 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  31.9 
 
 		 349 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  33.43 
 
 		 631 aa  181  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  36.89 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  32.12 
 
 		 346 aa  175  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  33.74 
 
 		 624 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1873  GGDEF  33.33 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0147389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  30.7 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0369  peptidyl-arginine deiminase  34.06 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  34.95 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  29.23 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4623  agmatine deiminase  35.99 
 
 		 346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.202175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  30.9 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  35.37 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  30.9 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0652  Agmatine deiminase  31.44 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  31.53 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2370  peptidyl-arginine deiminase  35.31 
 
 		 350 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  34.29 
 
 		 374 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0887  agmatine deiminase  31.23 
 
 		 370 aa  155  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  29.6 
 
 		 371 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2154  peptidyl-arginine deiminase  31.83 
 
 		 371 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  30.95 
 
 		 370 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  30.03 
 
 		 365 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  30.03 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  30.03 
 
 		 371 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  29.79 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  28.41 
 
 		 364 aa  150  2e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>