More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5056 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5056  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
249 aa  488  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
252 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.08 
 
 
251 aa  169  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2910  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.62 
 
 
251 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
258 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
248 aa  165  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.057049  hitchhiker  0.000702749 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214979  normal  0.444362 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2957  putative short-chain dehydrogenase/reductase  42.28 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3961  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 
243 aa  161  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.985096  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
251 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
252 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3393  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.42 
 
 
252 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.407663 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2455  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.52 
 
 
251 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000407954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
241 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.727774  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1619  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
253 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.901509  normal  0.0346671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.43 
 
 
265 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.76513  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
246 aa  156  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.86578  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.84 
 
 
244 aa  156  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.846723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 
271 aa  155  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
247 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
247 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal  0.690842 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.68 
 
 
245 aa  155  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  36.4 
 
 
255 aa  155  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.21 
 
 
255 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00771979  normal  0.364643 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36670  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  41.02 
 
 
252 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03264  dehydrogenase/reductase SDR family member 6  37.19 
 
 
256 aa  154  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0276  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.53 
 
 
260 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
246 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.335692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
254 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.387119 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
244 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal  0.122144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1946  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.8 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000538802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0174  short-chain dehydrogenase  39.09 
 
 
246 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.18 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.199274  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.51 
 
 
282 aa  152  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.32 
 
 
244 aa  152  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.550186  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0236  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.32 
 
 
244 aa  152  5e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.117254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3095  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.94 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.025547 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.28 
 
 
248 aa  152  7e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
250 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758731  normal  0.103076 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
258 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
254 aa  151  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.49 
 
 
246 aa  151  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
251 aa  151  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6404  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  35.14 
 
 
246 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
245 aa  150  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3324  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
254 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.933062  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
261 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.498935  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
254 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699646  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  40.24 
 
 
260 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  40.32 
 
 
257 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2773  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
253 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3057  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.25 
 
 
246 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.030998  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.6 
 
 
246 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
252 aa  149  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
245 aa  149  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
257 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3761  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
259 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3889  Short-chain dehydrogenase/reductase  42.08 
 
 
236 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521289  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
254 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.572061  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4150  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.08 
 
 
236 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.639156 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0167  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.55 
 
 
245 aa  149  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.619009  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0620  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
254 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 
244 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248002  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0175  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.33 
 
 
247 aa  148  6e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.2 
 
 
246 aa  148  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.1 
 
 
257 aa  148  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.560297 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
255 aa  148  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
262 aa  148  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742877  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.553116  normal  0.644711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2377  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.496864  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.319832  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2045  short chain dehydrogenase  37.55 
 
 
272 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
246 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.37 
 
 
245 aa  146  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.64 
 
 
267 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7201  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.10023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2063  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
244 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.351696  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
253 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1662  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.18 
 
 
245 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  35.57 
 
 
247 aa  145  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
256 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
247 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
265 aa  145  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  38.15 
 
 
257 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.372052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
244 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  35.18 
 
 
247 aa  144  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>