128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3483 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3483  Lipocalin family protein  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04134  outer membrane lipoprotein  58.72 
 
 		 189 aa  220  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5827  Lipocalin family protein  38.89 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6584  lipocalin-like protein  38.33 
 
 		 202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7080  Lipocalin family protein  36.32 
 
 		 205 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0197  putative outer membrane lipoprotein  35.5 
 
 		 202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1894  putative outer membrane lipoprotein, lipocalin Blc like  35.42 
 
 		 193 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.930658 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0052  Lipocalin family protein  34.44 
 
 		 191 aa  101  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5543  Lipocalin family protein  32.98 
 
 		 189 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.472799  normal  0.93837 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  31.69 
 
 		 159 aa  85.5  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  32.56 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  30.81 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0126  Lipocalin family protein  30.77 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  28.57 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  30.81 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  30.81 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  28.89 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46924  predicted protein  29.93 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0938391  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  32.61 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  28.77 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  31.41 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  33.1 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  34.21 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  32.45 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  31.91 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  30.94 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  30.94 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  29.63 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  30.6 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1950  Lipocalin family protein  27.84 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100956  normal  0.0832884 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  29.58 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  32 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  27.75 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  36.56 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03292  outer membrane lipoprotein; lipocalin  28.97 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  28.77 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  31.72 
 
 		 189 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  28.88 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  28.57 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  27.62 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  29.19 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  28.97 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  30.11 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  28.26 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.39 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  26.47 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  26.47 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  26.47 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  29.66 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  26.95 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  26.95 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0865  Lipocalin family protein  25.83 
 
 		 161 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  hitchhiker  0.00294878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  28.47 
 
 		 184 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  32.24 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  25.75 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  28.74 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  28.87 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  25.75 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  27.34 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  26.9 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  25.71 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  26.52 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  26.79 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  26.76 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  24.86 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  25.97 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  25.28 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  27.08 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  26.47 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  25.41 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  29.66 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  26.72 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0299  Lipocalin family protein  26.28 
 
 		 598 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  29.05 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  26.47 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  26.8 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  24.11 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  26.34 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0445  Lipocalin family protein  27.21 
 
 		 629 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  28.72 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  25.88 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  25.88 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  23.03 
 
 		 368 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  25.88 
 
 		 178 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  26.29 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  25.28 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  25.88 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  25.88 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  25.88 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  25.88 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  24 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  23.6 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  28.99 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  28.99 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  32.35 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  29.41 
 
 		 226 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  25.77 
 
 		 211 aa  51.2  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  23.87 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  24.66 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  24.66 
 
 		 176 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>