148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4700 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  100 
 
 
177 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  100 
 
 
177 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  100 
 
 
177 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  98.87 
 
 
177 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  98.31 
 
 
177 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  92.66 
 
 
177 aa  351  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  92.66 
 
 
177 aa  351  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  89.83 
 
 
177 aa  344  3e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  89.27 
 
 
177 aa  342  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  89.27 
 
 
177 aa  342  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  89.27 
 
 
177 aa  342  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  89.27 
 
 
177 aa  342  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  89.27 
 
 
177 aa  342  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  89.27 
 
 
177 aa  341  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  89.27 
 
 
178 aa  341  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  89.27 
 
 
178 aa  341  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  82.18 
 
 
176 aa  314  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  65.52 
 
 
174 aa  249  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  67.46 
 
 
189 aa  239  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  66.47 
 
 
194 aa  238  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  60.92 
 
 
174 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  62.43 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  63.89 
 
 
147 aa  203  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  56.71 
 
 
189 aa  201  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  56.71 
 
 
189 aa  201  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  57.14 
 
 
171 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  52.66 
 
 
187 aa  192  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  56.95 
 
 
170 aa  192  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  57.62 
 
 
176 aa  191  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  56.29 
 
 
180 aa  190  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  57.62 
 
 
177 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  56.95 
 
 
176 aa  189  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  52.57 
 
 
174 aa  187  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  50.86 
 
 
174 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  50 
 
 
174 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  50.56 
 
 
174 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  51.48 
 
 
198 aa  185  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  53.25 
 
 
170 aa  184  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  52.73 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  54.36 
 
 
172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  53.16 
 
 
204 aa  182  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  48.88 
 
 
174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  55.63 
 
 
171 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  49.4 
 
 
176 aa  178  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  49.4 
 
 
171 aa  176  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  49.7 
 
 
171 aa  175  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  49.38 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  45.76 
 
 
183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  49.06 
 
 
202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  54.79 
 
 
172 aa  170  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  47.09 
 
 
180 aa  170  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  51.27 
 
 
173 aa  170  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  51.9 
 
 
177 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  45.93 
 
 
185 aa  169  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  51.63 
 
 
182 aa  169  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  50.63 
 
 
200 aa  168  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  54 
 
 
179 aa  168  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  50.96 
 
 
208 aa  167  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  48.45 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  50 
 
 
182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  46.15 
 
 
174 aa  158  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0009  outer membrane lipoprotein blc  63.72 
 
 
114 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188728  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  50.98 
 
 
201 aa  158  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  43.2 
 
 
178 aa  157  8e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  46.24 
 
 
187 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  46.26 
 
 
176 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  50.68 
 
 
174 aa  154  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  47.17 
 
 
174 aa  154  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  41.38 
 
 
176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  47.18 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2211  Lipocalin family protein  49.22 
 
 
140 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  40.13 
 
 
164 aa  127  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  38.6 
 
 
181 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  38.2 
 
 
184 aa  123  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  38.89 
 
 
175 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  36.31 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  38.46 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  38.33 
 
 
190 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  38.33 
 
 
190 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  40.49 
 
 
182 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  37.22 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  37.78 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  40.69 
 
 
169 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  37.22 
 
 
181 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  37.22 
 
 
190 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  39.26 
 
 
189 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  35.47 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  36.84 
 
 
192 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  37.5 
 
 
180 aa  107  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  37.06 
 
 
192 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  38.61 
 
 
189 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  39.33 
 
 
179 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  36.42 
 
 
190 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  36.53 
 
 
226 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  35.83 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  35.44 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  38.76 
 
 
221 aa  95.5  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  35.75 
 
 
190 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  40.37 
 
 
164 aa  94.4  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  36.65 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>