146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1741 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  100 
 
 
167 aa  348  3e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  46.62 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  46.5 
 
 
187 aa  147  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  48.61 
 
 
181 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  47.55 
 
 
175 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  49.66 
 
 
170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  47.65 
 
 
172 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  46.58 
 
 
180 aa  142  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  47.18 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  47.18 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  47.18 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  47.18 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  47.18 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  47.52 
 
 
177 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  44.59 
 
 
194 aa  138  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  47.18 
 
 
177 aa  137  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  50 
 
 
190 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  44.3 
 
 
190 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  45.77 
 
 
177 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  45.77 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  45.77 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  45.77 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  45.77 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  46.48 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  45.77 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  45.77 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  45.77 
 
 
177 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  39.76 
 
 
184 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  43.48 
 
 
189 aa  134  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  45.07 
 
 
177 aa  134  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  45.65 
 
 
189 aa  133  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  42.77 
 
 
171 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  46.53 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  43.29 
 
 
189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  43.29 
 
 
189 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  46.72 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  44.44 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  42.68 
 
 
171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  41.67 
 
 
174 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  44.06 
 
 
177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  44.59 
 
 
171 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  45.99 
 
 
176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  40.88 
 
 
171 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  41.51 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  42.24 
 
 
185 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  41.07 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  41.07 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  40.25 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  40.59 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  41.14 
 
 
198 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  40.48 
 
 
174 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  38.01 
 
 
174 aa  124  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  43.84 
 
 
208 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  37.43 
 
 
174 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  42.76 
 
 
177 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  40.41 
 
 
179 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  38.96 
 
 
179 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  43.59 
 
 
161 aa  121  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  43.06 
 
 
202 aa  120  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  39.24 
 
 
174 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  41.4 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  42.36 
 
 
202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  38.89 
 
 
147 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  40.79 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  42.33 
 
 
192 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  42.94 
 
 
192 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  41.26 
 
 
200 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  38.01 
 
 
183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  39.74 
 
 
204 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  40.46 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  40.74 
 
 
174 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  40.46 
 
 
190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  41.45 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  39.1 
 
 
168 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  40.52 
 
 
189 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  40.91 
 
 
181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  41.43 
 
 
159 aa  111  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  38.06 
 
 
187 aa  111  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  41.45 
 
 
181 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  40.52 
 
 
182 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  43.71 
 
 
164 aa  111  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  39.71 
 
 
182 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  38.99 
 
 
164 aa  110  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  41.45 
 
 
181 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  41.43 
 
 
182 aa  110  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  37.91 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  39.35 
 
 
226 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  39.01 
 
 
182 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  36.48 
 
 
180 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  40 
 
 
172 aa  108  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  38.92 
 
 
184 aa  108  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  40.52 
 
 
189 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  39.73 
 
 
176 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  37.57 
 
 
190 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  43.07 
 
 
169 aa  105  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  41.84 
 
 
174 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  36.14 
 
 
174 aa  104  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  38.78 
 
 
174 aa  103  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  42.77 
 
 
221 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  39.22 
 
 
190 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>