144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1667 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  100 
 
 
174 aa  354  2.9999999999999997e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  71.88 
 
 
176 aa  244  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  68.21 
 
 
172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  55.76 
 
 
183 aa  195  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  51.81 
 
 
171 aa  187  7e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  52.07 
 
 
189 aa  186  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  52.07 
 
 
189 aa  186  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  53.61 
 
 
171 aa  185  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  55.28 
 
 
174 aa  185  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  51.15 
 
 
174 aa  185  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  53.25 
 
 
170 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  52.6 
 
 
172 aa  179  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  50.93 
 
 
187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  52.15 
 
 
180 aa  177  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  49.4 
 
 
171 aa  173  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  48.8 
 
 
171 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  48.73 
 
 
174 aa  167  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  46.88 
 
 
189 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  47.5 
 
 
194 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  47.31 
 
 
202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  47.27 
 
 
202 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  46.51 
 
 
177 aa  162  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  49.66 
 
 
177 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  49.66 
 
 
177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  45.66 
 
 
174 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  45.78 
 
 
174 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  46.99 
 
 
200 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  45.78 
 
 
174 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  46.15 
 
 
177 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  46.15 
 
 
177 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  46.15 
 
 
177 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  49.66 
 
 
177 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  49.66 
 
 
177 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  45.12 
 
 
171 aa  158  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  45.18 
 
 
174 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  45.62 
 
 
179 aa  157  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  47.1 
 
 
176 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  50 
 
 
177 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  48.3 
 
 
176 aa  155  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  45.68 
 
 
178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  45.68 
 
 
177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  45.68 
 
 
178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  46.45 
 
 
176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  45.68 
 
 
177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  45.68 
 
 
177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  45.68 
 
 
177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  45.68 
 
 
177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  42.6 
 
 
176 aa  152  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  44.38 
 
 
185 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  45.39 
 
 
170 aa  152  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  46.31 
 
 
178 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  46.98 
 
 
204 aa  151  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  45.06 
 
 
177 aa  151  4e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  44.94 
 
 
198 aa  151  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  47.06 
 
 
173 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  44.44 
 
 
177 aa  149  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  41.51 
 
 
187 aa  148  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  47.62 
 
 
174 aa  148  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  44.38 
 
 
174 aa  144  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  45.22 
 
 
182 aa  144  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  41.29 
 
 
168 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  46.58 
 
 
179 aa  142  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  44.37 
 
 
182 aa  141  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2211  Lipocalin family protein  50 
 
 
140 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  48.23 
 
 
208 aa  140  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  45.14 
 
 
147 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  38.51 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  39.05 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  44.14 
 
 
175 aa  124  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  38.32 
 
 
164 aa  117  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  37.35 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  43.06 
 
 
181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  42.75 
 
 
169 aa  115  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  42.96 
 
 
167 aa  112  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  38.89 
 
 
185 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  39.26 
 
 
184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0009  outer membrane lipoprotein blc  50.56 
 
 
114 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188728  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  37.34 
 
 
173 aa  104  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  38.75 
 
 
190 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  37.14 
 
 
189 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  38.61 
 
 
190 aa  97.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  33.11 
 
 
182 aa  91.3  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  36.55 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  34.81 
 
 
183 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0445  Lipocalin family protein  36.36 
 
 
629 aa  82.4  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  31.21 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  33.11 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0299  Lipocalin family protein  35.62 
 
 
598 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  31.03 
 
 
179 aa  80.9  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  34.84 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  37.41 
 
 
171 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  31.82 
 
 
192 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  32.93 
 
 
174 aa  77.8  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  32.22 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  32.77 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  32.22 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  34.93 
 
 
159 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  34.87 
 
 
164 aa  75.9  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  30.52 
 
 
192 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  34.04 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>