145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1238 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  55.48 
 
 		 159 aa  174  9e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  51.23 
 
 		 174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  52.26 
 
 		 161 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  43.24 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  45.07 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  35.58 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  47.11 
 
 		 179 aa  99.8  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  37.74 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  38.06 
 
 		 190 aa  99.4  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  40.43 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  37.24 
 
 		 175 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  38.62 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  37.76 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  44.07 
 
 		 173 aa  90.9  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  39.26 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  33.57 
 
 		 164 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  41.86 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  38 
 
 		 183 aa  89.4  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  35.85 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  35.57 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  36.48 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  35.06 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  34.19 
 
 		 189 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  33.77 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  36.55 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  35.57 
 
 		 171 aa  85.9  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  36.42 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  35.76 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0445  Lipocalin family protein  38.24 
 
 		 629 aa  84.7  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  34.46 
 
 		 174 aa  84.3  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  34.03 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  34.46 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  35.17 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  33.78 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  33.78 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  33.55 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  35.57 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  33.78 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  37.01 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  33.79 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  36.36 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  31.03 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  33.33 
 
 		 179 aa  80.9  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  32.89 
 
 		 171 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  33.11 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  34.39 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  33.33 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  37.6 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  33.78 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  33.76 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  34.81 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  34.97 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  34.69 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  34.97 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  34.97 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  34.97 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  34.97 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  34.46 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0865  Lipocalin family protein  33.1 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  hitchhiker  0.00294878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  33.85 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  32.41 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04134  outer membrane lipoprotein  33.07 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  37.29 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  35.04 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  33.83 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  32.65 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  36.64 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  32.65 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  32.65 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  36.97 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  33.33 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  33.11 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  33.33 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  32.65 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  33.33 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0299  Lipocalin family protein  34.59 
 
 		 598 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  36.52 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  33.33 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  33.33 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  33.33 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  32.43 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  30.56 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  33.33 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  30.87 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  32.65 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  36.29 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  36.29 
 
 		 177 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  30.52 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  29.73 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  31.94 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  36.44 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  32.19 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  29.75 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  31.97 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  32.17 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  32.87 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  32.43 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  33.33 
 
 		 368 aa  68.6  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>