137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3556 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  58.14 
 
 		 174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  57.8 
 
 		 174 aa  218  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  57.56 
 
 		 174 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  57.56 
 
 		 174 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  60.76 
 
 		 171 aa  214  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  54.65 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  62.42 
 
 		 173 aa  212  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  55.56 
 
 		 171 aa  208  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  60.38 
 
 		 177 aa  207  8e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  56.96 
 
 		 176 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  55.56 
 
 		 171 aa  206  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  57.23 
 
 		 176 aa  205  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  56.33 
 
 		 176 aa  204  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  59.62 
 
 		 170 aa  204  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  54.97 
 
 		 171 aa  202  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  53.05 
 
 		 171 aa  201  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  55.49 
 
 		 174 aa  200  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  59.48 
 
 		 170 aa  198  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  52.66 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  52.66 
 
 		 187 aa  194  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  55.84 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  48 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  48 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  50.62 
 
 		 168 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  45.93 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  47.43 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  45.93 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  45.93 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  47.43 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  45.88 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  45.88 
 
 		 189 aa  166  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  45.45 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  45.45 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  48.17 
 
 		 174 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  43.35 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  43.35 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  43.35 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  43.35 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  43.35 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  43.35 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  43.35 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  43.35 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  45.45 
 
 		 174 aa  160  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  43.71 
 
 		 201 aa  160  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  42.77 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  41.86 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  44.57 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  48.47 
 
 		 182 aa  157  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  48.65 
 
 		 147 aa  157  9e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  44.38 
 
 		 174 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2211  Lipocalin family protein  54.55 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  44.23 
 
 		 172 aa  149  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  39.88 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  39.77 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  42.53 
 
 		 180 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  40.46 
 
 		 174 aa  141  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  42.11 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  40.88 
 
 		 174 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  46.36 
 
 		 179 aa  136  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  39.86 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  40.49 
 
 		 198 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  44.23 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  38.71 
 
 		 208 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  39.88 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  39.47 
 
 		 178 aa  130  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  39.62 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  40.25 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  44.59 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  40 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  37.79 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  39.72 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  39.88 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  35.71 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  33.73 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0009  outer membrane lipoprotein blc  43.81 
 
 		 114 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  36.75 
 
 		 190 aa  97.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  32.32 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  32.3 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0878  lipoprotein Blc  57.33 
 
 		 81 aa  95.9  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  34.94 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  31.68 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  33.72 
 
 		 189 aa  92.8  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  32.8 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  32.28 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  32.37 
 
 		 184 aa  90.9  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  34.15 
 
 		 173 aa  90.9  9e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  32.61 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  32.61 
 
 		 190 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  31.21 
 
 		 181 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  31.21 
 
 		 181 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  33.15 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  30.64 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  33.33 
 
 		 179 aa  82.8  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  30.43 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  31.28 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  35.53 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  33.54 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  32.91 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0299  Lipocalin family protein  35.21 
 
 		 598 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0437808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>