146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0511 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  71.67 
 
 		 181 aa  264  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  70.49 
 
 		 188 aa  263  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  70.79 
 
 		 181 aa  258  4e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  70.22 
 
 		 181 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  63.91 
 
 		 189 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  64.29 
 
 		 182 aa  217  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  59.78 
 
 		 192 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  59.22 
 
 		 192 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  60.48 
 
 		 189 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  55.74 
 
 		 190 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  55.74 
 
 		 190 aa  197  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  54.05 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  56.89 
 
 		 190 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  55.7 
 
 		 184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  43.1 
 
 		 221 aa  135  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  49.01 
 
 		 368 aa  134  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  44.13 
 
 		 185 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  49.35 
 
 		 183 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  49.35 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  42.86 
 
 		 181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  41.86 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  40.22 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  42.46 
 
 		 189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  40.11 
 
 		 184 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  44.76 
 
 		 179 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  41.94 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  41.67 
 
 		 173 aa  117  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  42.29 
 
 		 194 aa  117  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  42.61 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  42.53 
 
 		 189 aa  114  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  40.24 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  41.57 
 
 		 190 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  42.13 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  37.5 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  37.5 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  38.12 
 
 		 171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  37.5 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  37.5 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  37.5 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  37.57 
 
 		 171 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  36.93 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  36.87 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  36.87 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  36.87 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  36.87 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  36.87 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  36.87 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  36.87 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  36.87 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  39.78 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0342  putative Blc-like protein  35.57 
 
 		 150 aa  103  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  44.29 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  44.29 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  36.41 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  36.41 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  39.66 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  33.9 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  36.31 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  39.08 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  36.72 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  39.44 
 
 		 186 aa  101  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  42.76 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  43.57 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  38.82 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  38.82 
 
 		 189 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  41.38 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  34.97 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  38.31 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  37.35 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  37.22 
 
 		 179 aa  99.4  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1532  putative homolog of BLC protein  36.73 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  36.87 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  38.79 
 
 		 201 aa  98.6  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  36.59 
 
 		 170 aa  97.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  36.78 
 
 		 187 aa  97.8  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  38.41 
 
 		 170 aa  97.4  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  35.88 
 
 		 187 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  34.22 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  34.22 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  38.65 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  33.9 
 
 		 164 aa  95.9  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  39.77 
 
 		 211 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  33.69 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  32.02 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  35.39 
 
 		 171 aa  95.5  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  34.22 
 
 		 174 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  36.99 
 
 		 147 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  38.71 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7080  Lipocalin family protein  37.28 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  36.87 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  35.36 
 
 		 177 aa  92.4  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  35.76 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  35.47 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  35.06 
 
 		 171 aa  92.4  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  38.36 
 
 		 204 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  37.06 
 
 		 179 aa  90.9  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  35.8 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  35.76 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5827  Lipocalin family protein  35 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>