147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1158 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  100 
 
 
171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  100 
 
 
171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  98.25 
 
 
171 aa  344  4e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  82.42 
 
 
166 aa  276  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  77.65 
 
 
171 aa  272  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  48.77 
 
 
164 aa  157  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  45.34 
 
 
368 aa  149  2e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  44.81 
 
 
226 aa  140  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  43.67 
 
 
221 aa  139  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  44.83 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  46 
 
 
179 aa  122  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  38.46 
 
 
189 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  42.28 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  41.61 
 
 
192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  35.14 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  40 
 
 
189 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  40.65 
 
 
182 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  33.97 
 
 
184 aa  105  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  39.02 
 
 
190 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  44.29 
 
 
180 aa  103  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  38.82 
 
 
189 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  39.73 
 
 
175 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  42.18 
 
 
186 aa  101  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  35.95 
 
 
211 aa  101  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  40.65 
 
 
173 aa  101  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  40.27 
 
 
188 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  41.61 
 
 
185 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  36.59 
 
 
190 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  36.59 
 
 
190 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  35.37 
 
 
190 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  39.04 
 
 
181 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  37.34 
 
 
179 aa  94.4  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  38.31 
 
 
184 aa  94.4  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  39.04 
 
 
181 aa  94  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  39.04 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  37.09 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  38.82 
 
 
194 aa  91.7  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  36.02 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  37.11 
 
 
177 aa  89.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  37.11 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  37.11 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  37.11 
 
 
177 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  38.12 
 
 
178 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  38.12 
 
 
178 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  36.48 
 
 
177 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  39.87 
 
 
171 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  38.36 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  38.36 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  35.71 
 
 
181 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  38.36 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  38.36 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  38.36 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  40 
 
 
176 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  40.54 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  36.08 
 
 
177 aa  85.9  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  35.85 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  36.84 
 
 
189 aa  85.5  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  37.58 
 
 
168 aa  85.1  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  36.71 
 
 
177 aa  85.1  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  31.79 
 
 
164 aa  84.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  33.97 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  33.33 
 
 
174 aa  84.7  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  32.88 
 
 
159 aa  84.3  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  34.23 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  35.85 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  35.85 
 
 
177 aa  83.2  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  34.13 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  32.91 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  32.72 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  37.76 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  36.08 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  33.94 
 
 
176 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  32.28 
 
 
171 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  32.91 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  36.62 
 
 
189 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  33.77 
 
 
161 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  36.88 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  35.1 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  32.72 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  34.39 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  35.71 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.301955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  34.67 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  33.94 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  40.65 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  35.17 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  34.48 
 
 
180 aa  78.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  36.88 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  39.35 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  32.89 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0342  putative Blc-like protein  31.21 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  33.54 
 
 
187 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  37.41 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  34.71 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  33.33 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  33.97 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  32.91 
 
 
172 aa  75.1  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  33.55 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  30.25 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  35.66 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  35.66 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>