142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3785 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  46.96 
 
 		 189 aa  150  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  42.54 
 
 		 184 aa  144  9e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  42.17 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  41.06 
 
 		 183 aa  128  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  36.46 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  38.51 
 
 		 368 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  40.13 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  40.72 
 
 		 164 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  39.16 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  37.63 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  40.13 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  35.79 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  41.1 
 
 		 173 aa  108  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  36.81 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  35.26 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  33.88 
 
 		 184 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  37.5 
 
 		 186 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  35.67 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  36.42 
 
 		 171 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  35.95 
 
 		 171 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  35.95 
 
 		 171 aa  101  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  35.95 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  35.95 
 
 		 166 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  39.77 
 
 		 180 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  35.59 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  36 
 
 		 181 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  36.13 
 
 		 159 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  35.43 
 
 		 181 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  35.43 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  39.85 
 
 		 189 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  35.58 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  36.31 
 
 		 189 aa  89  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  37.09 
 
 		 161 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  32.6 
 
 		 176 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  31.01 
 
 		 167 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  33.97 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0488  Lipocalin family protein  32.95 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  32.04 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  32.04 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  32.04 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  32.04 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  32.04 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  32.04 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  32.04 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  31.49 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  30.39 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  30.39 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  31.49 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  31.49 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0595  hypothetical protein  35.53 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  31.49 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2248  Lipocalin family protein  35.53 
 
 		 171 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  31.49 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  31.49 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  35.62 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  31.49 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  32.4 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  33.97 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  35.03 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  31.02 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4942  Lipocalin family protein  37.93 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122636  normal  0.309932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  31.02 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  32.1 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  35.04 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  35.06 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  30.92 
 
 		 190 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  34.74 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  34.13 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  29.83 
 
 		 189 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  32.92 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  29.83 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  29.35 
 
 		 190 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0515  Lipocalin family protein  33.55 
 
 		 172 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.10388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  27.89 
 
 		 180 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  28.96 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  32.26 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  34.18 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  34.81 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  30.97 
 
 		 174 aa  68.2  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  32.91 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  30.13 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1950  Lipocalin family protein  29.67 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100956  normal  0.0832884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  35.62 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  31.25 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  31.88 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  27.22 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  28.03 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  29.03 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  31.98 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  29.3 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0372  Lipocalin family protein  47.62 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  28.22 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  28.48 
 
 		 174 aa  62  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  28.95 
 
 		 176 aa  62  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  32.41 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  32.41 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  36.62 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  33.33 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  30.16 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>