135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0595 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0595  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2248  Lipocalin family protein  99.42 
 
 		 171 aa  343  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0515  Lipocalin family protein  82.25 
 
 		 172 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.10388 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  41.62 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  39.76 
 
 		 198 aa  104  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  39.18 
 
 		 181 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  38.32 
 
 		 184 aa  92.8  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  42.36 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  37.08 
 
 		 175 aa  90.9  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  38.51 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  40.44 
 
 		 185 aa  89  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  35.26 
 
 		 188 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  39.88 
 
 		 226 aa  84.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  39.88 
 
 		 182 aa  84  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  36.49 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  38.56 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  36.49 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  36.49 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  39.47 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  35.53 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  37.16 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  38.03 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  36.3 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  41.1 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  37.09 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  36.36 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  36.36 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  34.97 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  35.42 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  37.59 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  37.21 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  31.69 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  37.8 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  32.62 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  36.84 
 
 		 189 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  35.66 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2345  Lipocalin family protein  33.78 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.039817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  32.21 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  32.26 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  30.29 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  31.91 
 
 		 159 aa  67.4  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  24.7 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  29.87 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  30.92 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  29.17 
 
 		 161 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0421  hypothetical protein  31.47 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  30 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2077  Lipocalin family protein  31.47 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00774456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  28.9 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  31.69 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  30 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  35.77 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  31.54 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  35.46 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  35.04 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  35.04 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  30.52 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  35.46 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  25.99 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  35.04 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  37.82 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  29.87 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  25.99 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  32.84 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  32.14 
 
 		 198 aa  57.4  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  34.35 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  32.26 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1532  putative homolog of BLC protein  25 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4942  Lipocalin family protein  46.43 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122636  normal  0.309932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  25.42 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  25.42 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  32.8 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  34.23 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  31.2 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0488  Lipocalin family protein  29.3 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  30 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  37.01 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0445  Lipocalin family protein  32.37 
 
 		 629 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  30.77 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  30.77 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  30.77 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  34.19 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  34.19 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0052  Lipocalin family protein  30 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  30.77 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  30.77 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  30.77 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  30.77 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  30.71 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0342  putative Blc-like protein  25.38 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  30.77 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  25.64 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  30.77 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  30.52 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  30.15 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  30.39 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  30 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  30.3 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  31.06 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  31.06 
 
 		 177 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>