146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1685 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  100 
 
 
368 aa  764    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1506  hypothetical protein  79.01 
 
 
245 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  57.27 
 
 
221 aa  244  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  44.52 
 
 
183 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  46.84 
 
 
166 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  45.34 
 
 
171 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  45.34 
 
 
171 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  44.72 
 
 
171 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  44.44 
 
 
171 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  38.12 
 
 
184 aa  136  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  49.01 
 
 
180 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  42.58 
 
 
164 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  42.86 
 
 
179 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  41.03 
 
 
226 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  48.98 
 
 
192 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  45.81 
 
 
189 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  44.72 
 
 
188 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  45.16 
 
 
182 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  48.3 
 
 
192 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  43.59 
 
 
173 aa  124  3e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  46.31 
 
 
181 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  35.26 
 
 
189 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  40 
 
 
182 aa  123  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  38.51 
 
 
211 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  37.06 
 
 
190 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  44.97 
 
 
181 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  44.03 
 
 
189 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  44.97 
 
 
181 aa  119  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  42.76 
 
 
185 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  42.07 
 
 
175 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  38.65 
 
 
190 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  38.65 
 
 
190 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  39.1 
 
 
186 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  38.18 
 
 
190 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  38.78 
 
 
181 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  37.2 
 
 
184 aa  103  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  36.2 
 
 
190 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  36.73 
 
 
184 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  39.31 
 
 
167 aa  92.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  32.3 
 
 
189 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  37.25 
 
 
177 aa  87  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  37.75 
 
 
168 aa  86.7  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  35.12 
 
 
177 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  35.12 
 
 
177 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  35.12 
 
 
177 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  35.12 
 
 
177 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  35.12 
 
 
177 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  35.12 
 
 
178 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  35.12 
 
 
178 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  33.54 
 
 
190 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  37.66 
 
 
174 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  36.96 
 
 
177 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  35.52 
 
 
177 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  35.52 
 
 
177 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  35.52 
 
 
177 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  34.52 
 
 
177 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  34.52 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  36.41 
 
 
177 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0342  putative Blc-like protein  34.03 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  32.3 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  33.7 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  34.19 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  38.62 
 
 
176 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  35 
 
 
177 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  35 
 
 
177 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  34.25 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  36.99 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  38.62 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  32.93 
 
 
171 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  32.35 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  37.93 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  33.12 
 
 
147 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  32.34 
 
 
171 aa  79  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  38.85 
 
 
164 aa  78.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  36 
 
 
189 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  32.66 
 
 
198 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  35.1 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  35.1 
 
 
174 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  35.1 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  35.1 
 
 
177 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  35.1 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  34.55 
 
 
202 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  33.94 
 
 
202 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  32.34 
 
 
159 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  33.77 
 
 
176 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  31.72 
 
 
198 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  38.13 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  38.13 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  36.3 
 
 
182 aa  72.8  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4942  Lipocalin family protein  34.78 
 
 
127 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122636  normal  0.309932 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1532  putative homolog of BLC protein  29.86 
 
 
149 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  31.21 
 
 
179 aa  71.6  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  31.82 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  39.84 
 
 
200 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  33.33 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  31.65 
 
 
174 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2248  Lipocalin family protein  32.21 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  33.97 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0595  hypothetical protein  32.21 
 
 
171 aa  70.5  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  29.51 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>