140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1177 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  100 
 
 
169 aa  352  2e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  46.1 
 
 
171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  41.32 
 
 
174 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  45.77 
 
 
170 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  40.59 
 
 
171 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  43.23 
 
 
176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  45.45 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  41.32 
 
 
174 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  41.98 
 
 
177 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  43.42 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  43.42 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  42.58 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  40.72 
 
 
174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  40.96 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  41.57 
 
 
174 aa  124  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  39.51 
 
 
164 aa  124  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  45.83 
 
 
170 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  47.92 
 
 
171 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  43.66 
 
 
147 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  42.76 
 
 
187 aa  121  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  43.66 
 
 
174 aa  121  6e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  44.83 
 
 
172 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  43.33 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  42.59 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  37.93 
 
 
179 aa  117  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  41.38 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  41.38 
 
 
177 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  42.75 
 
 
174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  41.1 
 
 
180 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  42.25 
 
 
174 aa  115  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  40 
 
 
178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  40 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  40 
 
 
178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  40 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  40 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  40 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  40 
 
 
177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  40.69 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  40.69 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  42.03 
 
 
176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  43.57 
 
 
172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  40.69 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  40.97 
 
 
198 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  41.55 
 
 
173 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  39.31 
 
 
177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  36.59 
 
 
176 aa  111  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  40.29 
 
 
177 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  40.29 
 
 
177 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  41.5 
 
 
177 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  40.43 
 
 
189 aa  110  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  35.58 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  39.88 
 
 
185 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  38.62 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  42.14 
 
 
202 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  41.43 
 
 
202 aa  107  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  40.65 
 
 
200 aa  107  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  43.75 
 
 
204 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  39.86 
 
 
179 aa  106  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  43.07 
 
 
167 aa  105  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  37.76 
 
 
208 aa  101  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  40.41 
 
 
174 aa  99.8  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  36.96 
 
 
176 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  37.11 
 
 
187 aa  99  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  36.81 
 
 
182 aa  98.2  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  36.05 
 
 
176 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  37.67 
 
 
174 aa  95.1  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  35.17 
 
 
180 aa  94.4  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  37.14 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  40.58 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  36.6 
 
 
201 aa  91.3  6e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  39.01 
 
 
184 aa  90.9  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  36.36 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  37.5 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  36.65 
 
 
181 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  38.26 
 
 
173 aa  87.4  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  32.37 
 
 
181 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  32.37 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  34.9 
 
 
189 aa  85.5  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2211  Lipocalin family protein  40.65 
 
 
140 aa  84.7  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  32.08 
 
 
184 aa  84.7  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  36.91 
 
 
226 aa  84.3  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  36.24 
 
 
190 aa  84.3  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  34.56 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  35.86 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  31.21 
 
 
181 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  36.36 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  36.84 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  38.78 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  36.05 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  35.86 
 
 
192 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  36.05 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  33.33 
 
 
189 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  32.69 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0009  outer membrane lipoprotein blc  45.88 
 
 
114 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188728  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  36.55 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  34.48 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  34.9 
 
 
190 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  31.41 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  31.65 
 
 
221 aa  72  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  32.89 
 
 
190 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>