149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0356 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  66.3 
 
 		 192 aa  261  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  64.67 
 
 		 192 aa  256  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  62.84 
 
 		 190 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  62.84 
 
 		 190 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  61.7 
 
 		 190 aa  243  9e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  62.94 
 
 		 190 aa  234  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  58.56 
 
 		 188 aa  229  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  59.67 
 
 		 181 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  59.12 
 
 		 181 aa  224  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  59.12 
 
 		 181 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  60.12 
 
 		 182 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  59.77 
 
 		 189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  59.12 
 
 		 180 aa  216  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  52.12 
 
 		 184 aa  167  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  41.14 
 
 		 189 aa  124  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  39.89 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  43.87 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  46 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  44.03 
 
 		 368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  37.79 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  38.64 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  39.55 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  37.43 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  37.57 
 
 		 194 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  41.06 
 
 		 179 aa  110  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  37.3 
 
 		 180 aa  110  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  35.96 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  35.96 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  38.41 
 
 		 173 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  35.96 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  35.96 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  35.96 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  36.42 
 
 		 189 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  36 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  36 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  37.7 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  37.7 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  36 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  36 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  36 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  36 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  36 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  40.65 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  36 
 
 		 177 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  40.52 
 
 		 167 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  35.14 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  35.43 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  41.22 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  34.27 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  34.27 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  39.11 
 
 		 177 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  38.27 
 
 		 171 aa  104  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  38.82 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  38.82 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  36.21 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  38.82 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  37.79 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  35.39 
 
 		 187 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  34.46 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  36.31 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  37.93 
 
 		 183 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  36.31 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  36.81 
 
 		 170 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  33.9 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  36.31 
 
 		 174 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  38.51 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  37.04 
 
 		 166 aa  99  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  36.47 
 
 		 172 aa  99  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  36 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  33.14 
 
 		 176 aa  98.2  6e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  37.75 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  40 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  39.1 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  35.75 
 
 		 174 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  33.15 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  39.1 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  35.39 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  34.71 
 
 		 170 aa  95.5  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  34.48 
 
 		 174 aa  94.7  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  35.59 
 
 		 202 aa  94.7  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  33.9 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0342  putative Blc-like protein  31.79 
 
 		 150 aa  93.2  2e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  35.71 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  34.22 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  34.55 
 
 		 189 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  35.03 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  35.75 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  37.42 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  33.7 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  35.33 
 
 		 161 aa  90.5  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  33.13 
 
 		 168 aa  89.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  35.29 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  35.57 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  31.43 
 
 		 164 aa  88.6  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  36.13 
 
 		 179 aa  88.2  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  35.58 
 
 		 173 aa  88.2  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  35.8 
 
 		 177 aa  87.8  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  31.15 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  35.06 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>