147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4619 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  100 
 
 		 178 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  100 
 
 		 177 aa  368  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  100 
 
 		 177 aa  368  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  100 
 
 		 177 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  100 
 
 		 177 aa  368  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  100 
 
 		 177 aa  368  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  99.44 
 
 		 177 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  98.87 
 
 		 177 aa  363  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  89.27 
 
 		 177 aa  343  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  89.27 
 
 		 177 aa  342  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  89.27 
 
 		 177 aa  342  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  89.27 
 
 		 177 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  89.27 
 
 		 177 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  88.7 
 
 		 177 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  89.27 
 
 		 177 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  81.14 
 
 		 176 aa  313  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  63.79 
 
 		 174 aa  244  4.9999999999999997e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  65.66 
 
 		 189 aa  234  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  64.07 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  58.62 
 
 		 174 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  59.54 
 
 		 179 aa  224  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  57.14 
 
 		 189 aa  200  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  57.14 
 
 		 189 aa  200  7e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  62.5 
 
 		 147 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  57.62 
 
 		 180 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  56.95 
 
 		 170 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  51.2 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  50.86 
 
 		 174 aa  184  5e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  55.63 
 
 		 176 aa  184  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  54.97 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  50.29 
 
 		 174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  50.29 
 
 		 174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  50.29 
 
 		 174 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  54.97 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  52.12 
 
 		 171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  54.97 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  55.03 
 
 		 172 aa  180  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  50.89 
 
 		 198 aa  181  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  55.26 
 
 		 171 aa  178  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  49.14 
 
 		 174 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  54.84 
 
 		 204 aa  177  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  48.21 
 
 		 171 aa  176  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  49.39 
 
 		 176 aa  175  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  47.9 
 
 		 171 aa  174  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  50 
 
 		 170 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  49.38 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  52.63 
 
 		 172 aa  171  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  49.06 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  51.27 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  47.46 
 
 		 183 aa  167  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  45.35 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  50 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  50.32 
 
 		 173 aa  164  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  52.35 
 
 		 179 aa  164  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  52.23 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  50 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  43.35 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  45.96 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  48.67 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  45.68 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  46.71 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0009  outer membrane lipoprotein blc  60.18 
 
 		 114 aa  153  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  44.17 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  45.58 
 
 		 176 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  48.72 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  47.71 
 
 		 201 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  45.91 
 
 		 174 aa  147  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  45.77 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  47.55 
 
 		 176 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2211  Lipocalin family protein  50 
 
 		 140 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  41.72 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  39.41 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  41.18 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  38.15 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  38.55 
 
 		 184 aa  121  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  38.46 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  38.46 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  38.12 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  37.91 
 
 		 181 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  40 
 
 		 169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  38.04 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  36.61 
 
 		 190 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  36.61 
 
 		 190 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  36.31 
 
 		 192 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  37.42 
 
 		 173 aa  106  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  36.81 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  36.31 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  36.87 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  35.52 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  37.42 
 
 		 189 aa  103  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  40.97 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  37.13 
 
 		 226 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  36.93 
 
 		 190 aa  99  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  36.36 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  36.71 
 
 		 184 aa  95.5  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  34.55 
 
 		 190 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  35.2 
 
 		 189 aa  90.9  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  33.14 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  36.21 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>