149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2187 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  41.1 
 
 		 184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  37.37 
 
 		 190 aa  122  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0595  hypothetical protein  45.52 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2248  Lipocalin family protein  45.52 
 
 		 171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  43.45 
 
 		 189 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  44.59 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  42.38 
 
 		 226 aa  118  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  44.14 
 
 		 190 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  44.9 
 
 		 183 aa  117  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  41.22 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  38.6 
 
 		 198 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  39.08 
 
 		 181 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  44.59 
 
 		 164 aa  114  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  39.35 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  38.46 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  38.59 
 
 		 192 aa  110  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  42.47 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  39.13 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  39.1 
 
 		 368 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  42.47 
 
 		 190 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0515  Lipocalin family protein  41.01 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.10388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  36.26 
 
 		 181 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  36.26 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  36.26 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  43.33 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  41.78 
 
 		 190 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  41.1 
 
 		 190 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  41.13 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  38.26 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  37.5 
 
 		 211 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  38.51 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  37.64 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  42.96 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  41.5 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  42.18 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  42.18 
 
 		 171 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  39.44 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  47.33 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  42.18 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  40 
 
 		 189 aa  97.8  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  39.19 
 
 		 171 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  39.16 
 
 		 167 aa  96.7  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  35.14 
 
 		 161 aa  94.4  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  33.79 
 
 		 159 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  37.58 
 
 		 164 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  35.33 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  38.51 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  34.44 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  36.62 
 
 		 179 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  34.78 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  36.57 
 
 		 176 aa  84.7  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  40 
 
 		 170 aa  84.3  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  37.33 
 
 		 171 aa  84.3  9e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  38.82 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  33.11 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  35.8 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  35.8 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  36.77 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  36.77 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  36.42 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  36.77 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  36.77 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  36.77 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  36.77 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  36.77 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0342  putative Blc-like protein  31.47 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  38.93 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  35.52 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  35.96 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  35.96 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  35.52 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  35.52 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  36.84 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  36.71 
 
 		 177 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  38.78 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  36.71 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0445  Lipocalin family protein  39.34 
 
 		 629 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  34.67 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  33.76 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3483  Lipocalin family protein  32.61 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  37.75 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  33.11 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03292  outer membrane lipoprotein; lipocalin  30.41 
 
 		 172 aa  77.4  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  34 
 
 		 174 aa  77  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  33.94 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  36.36 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  34 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  34.95 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  36.07 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  34 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  36.3 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1532  putative homolog of BLC protein  30.28 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  34.64 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1950  Lipocalin family protein  29.53 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100956  normal  0.0832884 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0126  Lipocalin family protein  30.26 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  34.9 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  35.17 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  32.67 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  35.57 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>