146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2173 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  100 
 
 		 176 aa  361  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  76.02 
 
 		 174 aa  285  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  74.85 
 
 		 174 aa  283  8e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  74.85 
 
 		 174 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  74.27 
 
 		 174 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  74.12 
 
 		 171 aa  268  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  73.81 
 
 		 171 aa  265  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  71.34 
 
 		 171 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  66.47 
 
 		 177 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  70.32 
 
 		 176 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  69.68 
 
 		 176 aa  241  5e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  54.97 
 
 		 171 aa  222  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  57.99 
 
 		 187 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  56.89 
 
 		 171 aa  215  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  57.23 
 
 		 170 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  54.72 
 
 		 172 aa  207  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  61.94 
 
 		 173 aa  206  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  59.01 
 
 		 174 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  60.9 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  57.23 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  56.33 
 
 		 180 aa  200  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  60.13 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  54.09 
 
 		 168 aa  191  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  50.29 
 
 		 174 aa  187  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  49.7 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  49.7 
 
 		 189 aa  186  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  52.12 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  51.83 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  50 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  48 
 
 		 174 aa  178  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  49.4 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  49.4 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  49.4 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  49.4 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  48.19 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  48.19 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  49.39 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  49.39 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  49.39 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  49.39 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  49.39 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  49.39 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  49.39 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  49.39 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  48.78 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  50.68 
 
 		 147 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  45.78 
 
 		 176 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  42.86 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  44.71 
 
 		 183 aa  158  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  48.72 
 
 		 182 aa  157  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  43.12 
 
 		 204 aa  155  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  42.6 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  44.58 
 
 		 187 aa  154  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2211  Lipocalin family protein  50.39 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  44.59 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  42.01 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  44.17 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  40.94 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  42.6 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  43.9 
 
 		 180 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  42.41 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  43.79 
 
 		 176 aa  148  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  41.32 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  43.95 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  41.45 
 
 		 200 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  41.83 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  42.14 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  38.85 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  40.91 
 
 		 176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0878  lipoprotein Blc  73.75 
 
 		 81 aa  130  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  42.96 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  41.14 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  40.88 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  39.86 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0009  outer membrane lipoprotein blc  48.67 
 
 		 114 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  36.59 
 
 		 169 aa  111  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  34.76 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  36.14 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  33.12 
 
 		 182 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  34.59 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  34.59 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  33.12 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  32.52 
 
 		 173 aa  99.4  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  35.26 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  34.13 
 
 		 190 aa  99  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  32.8 
 
 		 192 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  35.48 
 
 		 179 aa  97.8  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  32.8 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  32.24 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  32.02 
 
 		 180 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  32.76 
 
 		 189 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  32.61 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  35 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  31.87 
 
 		 181 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  30.11 
 
 		 188 aa  90.9  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  36.18 
 
 		 164 aa  90.9  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  31.32 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  33.93 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  32.5 
 
 		 190 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  34.44 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>