146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3085 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  100 
 
 		 170 aa  353  6.999999999999999e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  58.54 
 
 		 174 aa  211  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  59.76 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  62.96 
 
 		 171 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  59.76 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  58.54 
 
 		 174 aa  204  3e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  58.54 
 
 		 174 aa  205  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  56.02 
 
 		 180 aa  204  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  57.93 
 
 		 174 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  56.97 
 
 		 171 aa  201  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  60.78 
 
 		 176 aa  201  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  57.93 
 
 		 174 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  58.28 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  57.32 
 
 		 185 aa  201  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  56.1 
 
 		 171 aa  200  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  55.49 
 
 		 171 aa  200  9e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  54.22 
 
 		 171 aa  200  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  60.13 
 
 		 176 aa  198  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  58.94 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  58.94 
 
 		 173 aa  198  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  55.49 
 
 		 194 aa  195  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  56.71 
 
 		 189 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  56.71 
 
 		 189 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  57.05 
 
 		 168 aa  192  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  56.77 
 
 		 170 aa  192  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  54.27 
 
 		 189 aa  191  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  54.84 
 
 		 172 aa  188  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  53.5 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  50.89 
 
 		 174 aa  187  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  49.71 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  49.71 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  49.71 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  54.6 
 
 		 179 aa  185  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  52.87 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  47.93 
 
 		 174 aa  180  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  49.68 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  49.68 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  49.68 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  49.68 
 
 		 178 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  49.68 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  49.68 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  49.68 
 
 		 178 aa  175  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  49.68 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  49.68 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  49.68 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  49.04 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  51.97 
 
 		 202 aa  167  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  49.31 
 
 		 147 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  51.32 
 
 		 202 aa  166  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  47.77 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  51.32 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  48.1 
 
 		 201 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  48.41 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  45.34 
 
 		 174 aa  157  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  47.37 
 
 		 172 aa  157  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  45.7 
 
 		 182 aa  157  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  43.51 
 
 		 204 aa  154  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  46.26 
 
 		 208 aa  153  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  45.62 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  45.96 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  44.16 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  49.04 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  46.71 
 
 		 200 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  44.08 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  43.93 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  39.76 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2211  Lipocalin family protein  55.26 
 
 		 140 aa  144  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  43.79 
 
 		 174 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  43.51 
 
 		 187 aa  142  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  44.44 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  40.62 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  45.77 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  43.66 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  39.26 
 
 		 175 aa  121  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0009  outer membrane lipoprotein blc  53.7 
 
 		 114 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  38.51 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  35 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  34.16 
 
 		 189 aa  104  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  36.21 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  36.75 
 
 		 173 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  35.63 
 
 		 181 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  35.63 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  35.44 
 
 		 184 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  36.47 
 
 		 188 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  35.98 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  37.27 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  36.97 
 
 		 180 aa  99  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  34.25 
 
 		 190 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  34.25 
 
 		 190 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  33.52 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  36.55 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  36.91 
 
 		 192 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  33.14 
 
 		 190 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  36.73 
 
 		 190 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  37.01 
 
 		 226 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  39.6 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  33.95 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  36.91 
 
 		 192 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  34.16 
 
 		 190 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  35.37 
 
 		 183 aa  85.9  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>