38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1506 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1506  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  511  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  79.01 
 
 		 368 aa  393  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  46.73 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  77.42 
 
 		 192 aa  62  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  74.19 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  74.19 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  64.86 
 
 		 173 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  60 
 
 		 182 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  60 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  58.97 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  63.33 
 
 		 181 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  57.14 
 
 		 181 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  63.33 
 
 		 181 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  51.35 
 
 		 179 aa  52.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  66.67 
 
 		 180 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  47.37 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  47.37 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  42.59 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  47.37 
 
 		 171 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4942  Lipocalin family protein  36.36 
 
 		 127 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122636  normal  0.309932 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  45.95 
 
 		 184 aa  49.3  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  46.15 
 
 		 171 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  50 
 
 		 166 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  44.44 
 
 		 183 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  43.14 
 
 		 182 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  36.07 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  60 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  60 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  54.29 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  54.55 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  42.5 
 
 		 184 aa  45.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  50 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  53.33 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  57.14 
 
 		 175 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  56.67 
 
 		 184 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0342  putative Blc-like protein  51.72 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  57.14 
 
 		 185 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  45.95 
 
 		 164 aa  42  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>