14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0421 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0421  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  324  3e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2077  Lipocalin family protein  98.19 
 
 		 166 aa  318  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00774456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2345  Lipocalin family protein  84.83 
 
 		 167 aa  248  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.039817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  42.01 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0515  Lipocalin family protein  34.97 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.10388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2248  Lipocalin family protein  32.17 
 
 		 171 aa  64.3  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0595  hypothetical protein  31.47 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  30.59 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  25.86 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  25.86 
 
 		 190 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  37.5 
 
 		 368 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  39.13 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  28.4 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  24.71 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>