127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0515 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0515  Lipocalin family protein  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.10388 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2248  Lipocalin family protein  82.84 
 
 		 171 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0595  hypothetical protein  82.25 
 
 		 171 aa  271  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  41.01 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  41.52 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  36.21 
 
 		 181 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  37.21 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  34.68 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  38.95 
 
 		 182 aa  84.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  37.06 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  37.06 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  38.04 
 
 		 226 aa  77.4  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  32.95 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  34.08 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  35.29 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  37.96 
 
 		 184 aa  74.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  35.39 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2345  Lipocalin family protein  35.66 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.039817  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  35.29 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  31.33 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  31.33 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  31.33 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  34.85 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  35.62 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0421  hypothetical protein  34.97 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  34.04 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2077  Lipocalin family protein  34.97 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00774456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  31.25 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  36.81 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  33.82 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  26.74 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  34.35 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  33.82 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  34.88 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  33.82 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  34.04 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  32.09 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  29.61 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  33.1 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  31.21 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  33.82 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  32.62 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  29.58 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  27.37 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  36.64 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  31.25 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  32.59 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  35.04 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  29.49 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0488  Lipocalin family protein  29.94 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  35.11 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  35.11 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0342  putative Blc-like protein  28.03 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  35.11 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  35.11 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  27.37 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  27.56 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  27.92 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  31.54 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  31.54 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  31.54 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  31.54 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  31.54 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  31.54 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  31.54 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  27.56 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1532  putative homolog of BLC protein  23.66 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  25.14 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  30 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  28.85 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  25.14 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0445  Lipocalin family protein  36.11 
 
 		 629 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  28.89 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0299  Lipocalin family protein  32.37 
 
 		 598 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  36.59 
 
 		 178 aa  52.4  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  33.33 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2033  lipoprotein Blc  33.59 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0137877  normal  0.799325 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  30.77 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  30.77 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  27.75 
 
 		 183 aa  51.2  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  33.9 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  30.77 
 
 		 177 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  30 
 
 		 198 aa  50.8  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  33.9 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  24.58 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  37.3 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  24.58 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  33.9 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  30 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  30 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  28.99 
 
 		 179 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  30 
 
 		 177 aa  48.5  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0052  Lipocalin family protein  28.17 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  30 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4942  Lipocalin family protein  42.86 
 
 		 127 aa  48.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122636  normal  0.309932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  30 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  28.77 
 
 		 171 aa  48.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  30 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  33.33 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0865  Lipocalin family protein  24.14 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  hitchhiker  0.00294878 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>