106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0052 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0052  Lipocalin family protein  100 
 
 
191 aa  391  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7080  Lipocalin family protein  49.15 
 
 
205 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5827  Lipocalin family protein  46.63 
 
 
206 aa  159  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0197  putative outer membrane lipoprotein  45.7 
 
 
202 aa  148  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6584  lipocalin-like protein  46.86 
 
 
202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1894  putative outer membrane lipoprotein, lipocalin Blc like  38.1 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.930658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5543  Lipocalin family protein  36.65 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.472799  normal  0.93837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3483  Lipocalin family protein  35.48 
 
 
200 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0126  Lipocalin family protein  29.35 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1950  Lipocalin family protein  31.9 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100956  normal  0.0832884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04134  outer membrane lipoprotein  32.05 
 
 
189 aa  79  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  31.43 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  30.51 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  29.61 
 
 
181 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  29.61 
 
 
181 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  29.61 
 
 
181 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03292  outer membrane lipoprotein; lipocalin  31.29 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  31.74 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  32.4 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  32.04 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  28.41 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  27.33 
 
 
190 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  25 
 
 
189 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  27.33 
 
 
190 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  29.31 
 
 
187 aa  61.2  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46924  predicted protein  27.15 
 
 
189 aa  61.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0938391  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  32.43 
 
 
171 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  26.9 
 
 
159 aa  58.2  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  25.58 
 
 
190 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  31.11 
 
 
181 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  29.7 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  28.47 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  28.57 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  30.99 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  30.99 
 
 
171 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  29.7 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0299  Lipocalin family protein  30.26 
 
 
598 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  26.45 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  25 
 
 
189 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  29.94 
 
 
164 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.1 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0595  hypothetical protein  30 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  30.28 
 
 
171 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  26.28 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  26.4 
 
 
192 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  25 
 
 
182 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  27.63 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  24.82 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  25.48 
 
 
368 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2248  Lipocalin family protein  29.29 
 
 
171 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.385259 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  25.57 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  25.82 
 
 
190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  25.31 
 
 
161 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  26.86 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  23.24 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1532  putative homolog of BLC protein  25.35 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  25.36 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  24.12 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  26.86 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  26.86 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  26.86 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  21.64 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  21.64 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  23.49 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  27.33 
 
 
198 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0140  Lipocalin family protein  27.38 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0911152  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  27.21 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0865  Lipocalin family protein  25.16 
 
 
161 aa  49.7  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  hitchhiker  0.00294878 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0445  Lipocalin family protein  28.68 
 
 
629 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0515  Lipocalin family protein  28.17 
 
 
172 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.10388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  26.29 
 
 
177 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  31.9 
 
 
166 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  26.35 
 
 
180 aa  48.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  27.82 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  23.08 
 
 
221 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  25.17 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  23.93 
 
 
174 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  26.59 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  25.71 
 
 
176 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  24.73 
 
 
189 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  25.86 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  25.86 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  27.74 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  26.71 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  25.86 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  25.86 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  25.86 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  25.86 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  25.86 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  25.86 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  25.62 
 
 
171 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  26.35 
 
 
186 aa  44.7  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  26.82 
 
 
198 aa  44.7  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  26.28 
 
 
201 aa  44.7  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  24.54 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  25.29 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  24 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  24 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  24.86 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  23.94 
 
 
147 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>