145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0299 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0445  Lipocalin family protein  65.18 
 
 
629 aa  771    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0299  Lipocalin family protein  100 
 
 
598 aa  1196    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1256  hypothetical protein  35.64 
 
 
588 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.723745  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1255  hypothetical protein  40.94 
 
 
572 aa  174  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.372139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0365  hypothetical protein  41.26 
 
 
553 aa  172  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0370  hypothetical protein  37.84 
 
 
578 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4414  hypothetical protein  41.61 
 
 
595 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4253  hypothetical protein  40.91 
 
 
597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287422  normal  0.118632 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5098  hypothetical protein  38.39 
 
 
574 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0685523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4638  hypothetical protein  37.24 
 
 
376 aa  128  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  41.54 
 
 
174 aa  93.2  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2002  hypothetical protein  33.43 
 
 
468 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.520959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  38.22 
 
 
181 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  34.9 
 
 
159 aa  87  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  38.24 
 
 
184 aa  85.5  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  34.62 
 
 
175 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  37.69 
 
 
161 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  35.37 
 
 
202 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  38.41 
 
 
204 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  35.37 
 
 
202 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  37.78 
 
 
185 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  34.53 
 
 
190 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  35.62 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  38.26 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  36.3 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  36.67 
 
 
189 aa  77  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  35.21 
 
 
185 aa  77  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  33.8 
 
 
198 aa  76.6  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0488  Lipocalin family protein  36.42 
 
 
207 aa  76.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  34.03 
 
 
190 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  39.84 
 
 
178 aa  75.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  35.76 
 
 
173 aa  75.5  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  33.33 
 
 
172 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  38.24 
 
 
174 aa  73.9  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  37.78 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  34.33 
 
 
171 aa  72.8  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  34.33 
 
 
194 aa  72.8  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  34.59 
 
 
179 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  35.71 
 
 
189 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  33.81 
 
 
189 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  34.87 
 
 
190 aa  72  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  34.29 
 
 
177 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  37.16 
 
 
174 aa  71.2  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  35.04 
 
 
167 aa  71.2  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  33.82 
 
 
179 aa  70.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  34.53 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  34.53 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  34.53 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  35 
 
 
171 aa  70.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  33.09 
 
 
180 aa  70.5  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  33.58 
 
 
164 aa  70.5  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  37.04 
 
 
176 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  37.04 
 
 
174 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  35.82 
 
 
180 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  35.82 
 
 
176 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  32.1 
 
 
180 aa  69.7  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  31.48 
 
 
170 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  35.26 
 
 
177 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  35.26 
 
 
177 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  29.63 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  34.69 
 
 
182 aa  68.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  35.26 
 
 
177 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  35.26 
 
 
177 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  35.26 
 
 
177 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  35.26 
 
 
178 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  31.25 
 
 
177 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  31.25 
 
 
177 aa  68.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  34.48 
 
 
176 aa  68.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  35.26 
 
 
178 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  33.09 
 
 
192 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  31.65 
 
 
189 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  32.89 
 
 
171 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  29.01 
 
 
172 aa  67  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  33.33 
 
 
177 aa  67  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  31.25 
 
 
174 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  33.33 
 
 
183 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  33.33 
 
 
177 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  34.48 
 
 
186 aa  66.6  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  32.89 
 
 
171 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  32.89 
 
 
171 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  31.75 
 
 
147 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  32.17 
 
 
176 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  32.14 
 
 
183 aa  66.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  33.33 
 
 
187 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  33.33 
 
 
171 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  32.39 
 
 
171 aa  65.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  33.55 
 
 
177 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  32.61 
 
 
188 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  31.65 
 
 
182 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  33.09 
 
 
192 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1991  outer membrane lipoprotein, lipocalin  30.13 
 
 
182 aa  64.3  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.486908  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  35.04 
 
 
171 aa  64.3  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  31.69 
 
 
176 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  32.89 
 
 
166 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  33.1 
 
 
187 aa  64.3  0.000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5827  Lipocalin family protein  30.66 
 
 
206 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  32.69 
 
 
177 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  32.69 
 
 
177 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  34.31 
 
 
171 aa  63.5  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  32.69 
 
 
177 aa  63.9  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>