107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0372 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0372  Lipocalin family protein  100 
 
 		 70 aa  143  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  81.54 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  60.32 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  50.77 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  46.88 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  48.44 
 
 		 226 aa  67.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  43.08 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  44.12 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  41.27 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  47.62 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  38.71 
 
 		 368 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  50 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  44.26 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  40.62 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  42.86 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  40 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  42.86 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  35.38 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  44.23 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  42.86 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  42.86 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  43.08 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  44.64 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  45.9 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  42.19 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  44.44 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  44.44 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  43.08 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  44.44 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  44.83 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  45.61 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  44.64 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  42.86 
 
 		 189 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  45.61 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  45.61 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  45.61 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  45.61 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  45.61 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  45.61 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  45.61 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  45.61 
 
 		 177 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  45.61 
 
 		 178 aa  53.5  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  39.68 
 
 		 184 aa  52.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  44.64 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  44.64 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  44.64 
 
 		 181 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  38.1 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  43.86 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  39.29 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  39.29 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4739  hypothetical protein  47.83 
 
 		 49 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  46.55 
 
 		 187 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  39.29 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  43.1 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  45.61 
 
 		 179 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  42.11 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  42.11 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0824  lipoprotein Blc  39.66 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.424755  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  39.66 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0878  lipoprotein Blc  38.98 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  38.6 
 
 		 194 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  40.38 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  34.38 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  39.06 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  39.29 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  37.93 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  42.11 
 
 		 174 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  38.6 
 
 		 189 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0445  Lipocalin family protein  48.84 
 
 		 629 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  37.88 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  38.1 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  38.71 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  35.71 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  35.71 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45620  Lipocalin-like protein  56.76 
 
 		 184 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  38.71 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  36.76 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  38.46 
 
 		 177 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  36.76 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  36.21 
 
 		 176 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  34.78 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  35.48 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  32.26 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  35.48 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  35.48 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  34.48 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  41.67 
 
 		 179 aa  45.4  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0299  Lipocalin family protein  37.5 
 
 		 598 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  36.21 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0126  Lipocalin family protein  28.57 
 
 		 179 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  30.65 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  34.85 
 
 		 174 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  34.85 
 
 		 174 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0865  Lipocalin family protein  30.91 
 
 		 161 aa  43.5  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  hitchhiker  0.00294878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  37.68 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  36.92 
 
 		 204 aa  42.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1532  putative homolog of BLC protein  36.54 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  34.85 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  36.21 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03292  outer membrane lipoprotein; lipocalin  35.19 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>