51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4739 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4739  hypothetical protein  100 
 
 		 49 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  63.83 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4943  hypothetical protein  82.35 
 
 		 36 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.120825  normal  0.359409 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  58.7 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  57.45 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  53.33 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0372  Lipocalin family protein  47.83 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  57.14 
 
 		 211 aa  50.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  50 
 
 		 185 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  54.05 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  50 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  45.65 
 
 		 176 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  47.83 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  41.3 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  41.3 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  41.3 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  41.3 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  41.3 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  50 
 
 		 190 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  41.3 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  41.3 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  41.3 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  41.3 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  41.3 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  41.3 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  45 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  43.59 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  43.59 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  45 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  45 
 
 		 192 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  45 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  45 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  45 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  45 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  47.83 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  47.5 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  50 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  45 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  40 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  50 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  47.22 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  44.19 
 
 		 164 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0126  Lipocalin family protein  35.56 
 
 		 179 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  51.35 
 
 		 189 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  42.86 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  45.95 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  47.5 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  47.5 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1498  Lipocalin family protein  43.59 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  45 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  45 
 
 		 189 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>