140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0126 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0126  Lipocalin family protein  100 
 
 
179 aa  370  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1950  Lipocalin family protein  52.1 
 
 
177 aa  184  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100956  normal  0.0832884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03292  outer membrane lipoprotein; lipocalin  51.5 
 
 
172 aa  181  7e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46924  predicted protein  40.12 
 
 
189 aa  124  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0938391  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5827  Lipocalin family protein  37.99 
 
 
206 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6584  lipocalin-like protein  37.2 
 
 
202 aa  111  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0197  putative outer membrane lipoprotein  34.68 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7080  Lipocalin family protein  34.68 
 
 
205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  32.77 
 
 
181 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  31.95 
 
 
175 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  31.1 
 
 
185 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5543  Lipocalin family protein  29.55 
 
 
189 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.472799  normal  0.93837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0865  Lipocalin family protein  34.31 
 
 
161 aa  94.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  hitchhiker  0.00294878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.15 
 
 
179 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1894  putative outer membrane lipoprotein, lipocalin Blc like  26.92 
 
 
193 aa  92.8  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.930658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  30 
 
 
184 aa  88.2  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  27.11 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3483  Lipocalin family protein  30.56 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0052  Lipocalin family protein  30.63 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  27.54 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  27.62 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  29.82 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  27.54 
 
 
177 aa  82  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  29.82 
 
 
190 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  29.82 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  27.59 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  27.59 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  27.59 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  28.16 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  26.35 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  26.29 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  29.48 
 
 
181 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04134  outer membrane lipoprotein  30.18 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  29.93 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  29.48 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  29.48 
 
 
181 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  26.35 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  26.35 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  26.35 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  26.35 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  26.35 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  26.35 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  26.35 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  25.6 
 
 
182 aa  76.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  26.06 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  26.44 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  28.25 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  24.57 
 
 
177 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  27.54 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  30.26 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  26.44 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  26.44 
 
 
177 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  30.14 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  28.77 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  28.39 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  25.86 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  27.91 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  23.75 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  27.91 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  27.16 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  29.33 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  23.75 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  23.43 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  28.21 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  23.81 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  23.43 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  26.04 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  26.63 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  23.43 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  27.85 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  25.67 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  25.43 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  24.36 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1177  Lipocalin family protein  25.93 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  25.44 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  25 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  23.38 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  22.86 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  25 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  26.62 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  25.58 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  24.12 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  22.49 
 
 
187 aa  64.3  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  22.29 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  26.11 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  24.69 
 
 
170 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  25.86 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  25.83 
 
 
189 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  25.32 
 
 
168 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  25 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  24.24 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  25.86 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0868  lipoprotein Blc  19.77 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  21.88 
 
 
177 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  28 
 
 
179 aa  62  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  22.35 
 
 
187 aa  62.4  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  22.93 
 
 
172 aa  62  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  24.86 
 
 
189 aa  62  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  23.21 
 
 
171 aa  61.6  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  24.86 
 
 
368 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>