127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1894 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1894  putative outer membrane lipoprotein, lipocalin Blc like  100 
 
 
193 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.930658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5543  Lipocalin family protein  78.24 
 
 
189 aa  315  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.472799  normal  0.93837 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5827  Lipocalin family protein  48.69 
 
 
206 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6584  lipocalin-like protein  52.84 
 
 
202 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7080  Lipocalin family protein  48.35 
 
 
205 aa  184  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0197  putative outer membrane lipoprotein  44.33 
 
 
202 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0052  Lipocalin family protein  38.76 
 
 
191 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1950  Lipocalin family protein  30.68 
 
 
177 aa  104  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100956  normal  0.0832884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03292  outer membrane lipoprotein; lipocalin  33.33 
 
 
172 aa  97.8  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3483  Lipocalin family protein  33.85 
 
 
200 aa  94.7  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0126  Lipocalin family protein  26.92 
 
 
179 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04134  outer membrane lipoprotein  32.56 
 
 
189 aa  85.1  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  34.18 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  34.27 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  30.17 
 
 
190 aa  72  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  30.41 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  31.45 
 
 
175 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  28.85 
 
 
172 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46924  predicted protein  26.39 
 
 
189 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0938391  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  29.28 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  28.17 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  29.05 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  30.69 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  27.5 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  31.47 
 
 
167 aa  64.3  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  29.21 
 
 
183 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  25.58 
 
 
164 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  27.59 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  28.57 
 
 
170 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  27.66 
 
 
176 aa  62  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  29.21 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  26.88 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  28.87 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  26.11 
 
 
180 aa  59.7  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  31.21 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  29.65 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  28.33 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1667  Lipocalin family protein  27.49 
 
 
174 aa  59.7  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047645  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  26.06 
 
 
161 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  27.62 
 
 
194 aa  58.9  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  25 
 
 
180 aa  58.9  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  29.83 
 
 
189 aa  57.8  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  25 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  25 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  26.71 
 
 
187 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  28.08 
 
 
177 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  26.8 
 
 
171 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  25 
 
 
181 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  27.86 
 
 
172 aa  57  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  30.14 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  29.93 
 
 
183 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  28.77 
 
 
176 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  27.4 
 
 
177 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  28.81 
 
 
190 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  28.77 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  28.83 
 
 
184 aa  55.1  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  28.81 
 
 
190 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  26.28 
 
 
184 aa  54.7  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  26.39 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  26.39 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  25 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  27.27 
 
 
180 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  26.39 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  26.39 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  26.14 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  27.16 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  26.39 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  26.74 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  26.03 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  26.39 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  26.39 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  26.39 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  26.39 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  26.39 
 
 
178 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  25.97 
 
 
170 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  25.87 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  27.59 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  28.28 
 
 
177 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  28.28 
 
 
177 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  25.15 
 
 
171 aa  52  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1158  Lipocalin-like protein  29.03 
 
 
171 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0694  Lipocalin family protein  29.21 
 
 
174 aa  51.6  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1175  Lipocalin family protein  29.03 
 
 
171 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.176258 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2835  Lipocalin family protein  28.26 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.345379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  24.85 
 
 
174 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  25.99 
 
 
190 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  27.08 
 
 
174 aa  51.2  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  27.98 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3760  Lipocalin family protein  31.79 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  24.85 
 
 
174 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  24.85 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  24.66 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0299  Lipocalin family protein  26.32 
 
 
598 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  28.38 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  22.97 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  24.85 
 
 
174 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  26.57 
 
 
173 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  27.62 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  24.11 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1185  Lipocalin family protein  28.39 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.0428509 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>