136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0197 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0197  putative outer membrane lipoprotein  100 
 
 
202 aa  417  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7080  Lipocalin family protein  89.27 
 
 
205 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5827  Lipocalin family protein  72.5 
 
 
206 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6584  lipocalin-like protein  75 
 
 
202 aa  288  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1894  putative outer membrane lipoprotein, lipocalin Blc like  45.36 
 
 
193 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.930658 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5543  Lipocalin family protein  43.01 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.472799  normal  0.93837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0052  Lipocalin family protein  46.86 
 
 
191 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1950  Lipocalin family protein  38.41 
 
 
177 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100956  normal  0.0832884 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3483  Lipocalin family protein  34.5 
 
 
200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0126  Lipocalin family protein  35.26 
 
 
179 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03292  outer membrane lipoprotein; lipocalin  38.73 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04134  outer membrane lipoprotein  32.66 
 
 
189 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  35.56 
 
 
180 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  36 
 
 
181 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  32.61 
 
 
181 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  33.53 
 
 
188 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  32.61 
 
 
181 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  32.61 
 
 
181 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5266  Lipocalin family protein  32.57 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.940719 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  32.37 
 
 
185 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  30.99 
 
 
173 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1430  Lipocalin family protein  30.64 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000184324 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  29.57 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  30.18 
 
 
175 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5824  Lipocalin family protein  30 
 
 
189 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623349  normal  0.476502 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  28.24 
 
 
180 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1355  putative outer membrane lipoprotein Blc  31.43 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.170424  hitchhiker  0.00967009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2786  Lipocalin family protein  29.88 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46924  predicted protein  28.86 
 
 
189 aa  75.5  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0938391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  30.97 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  28.73 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  30.29 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  29.71 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  27.27 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  32.89 
 
 
167 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  29.8 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1691  lipoprotein Blc  26.26 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  29.8 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  30.65 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  29.33 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  27.32 
 
 
184 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2973  Lipocalin family protein  30.19 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190795  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  26.52 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  29.61 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2400  Lipocalin family protein  30.38 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  26.79 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0356  lipoprotein Blc  29.14 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  26.76 
 
 
159 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  30.95 
 
 
171 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  28.57 
 
 
164 aa  67  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  28.65 
 
 
177 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  28.65 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  28.65 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  28.65 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  28.65 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  25.7 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  29.63 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  28.65 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  28.65 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  28.65 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  27.87 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6237  outer membrane lipoprotein, lipocalin  28.3 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.418394  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1101  Lipocalin family protein  29.88 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  31.01 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  25.68 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0469  outer membrane lipoprotein Blc  28.42 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  28.47 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  28.09 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  26.82 
 
 
177 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  30.32 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  26.82 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  26.82 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  26.82 
 
 
177 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  26.82 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  29.33 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  29.49 
 
 
174 aa  63.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  29.34 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0639  Lipocalin family protein  27.15 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  29.26 
 
 
194 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2652  Lipocalin family protein  25.29 
 
 
176 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.392494  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0299  Lipocalin family protein  28.38 
 
 
598 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2585  Lipocalin family protein  24.71 
 
 
176 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0822129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  27.32 
 
 
190 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  30.52 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  28.82 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1095  Lipocalin-like protein  28.82 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0865  Lipocalin family protein  25.16 
 
 
161 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  hitchhiker  0.00294878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  26.23 
 
 
176 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  29.51 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  30.92 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  26.7 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  30.22 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  25.41 
 
 
185 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  26.26 
 
 
177 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  26.26 
 
 
177 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  26.99 
 
 
180 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3140  Lipocalin family protein  29.3 
 
 
204 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.276328  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  24.48 
 
 
190 aa  58.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2185  Lipocalin family protein  25.73 
 
 
174 aa  58.2  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.012545  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  26.11 
 
 
174 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>