131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46924 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46924  predicted protein  100 
 
 		 189 aa  393  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0938391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0126  Lipocalin family protein  40.12 
 
 		 179 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2326  outer membrane lipoprotein  30.71 
 
 		 185 aa  87.8  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0151  Lipocalin family protein  32.64 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.46331  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1950  Lipocalin family protein  31.1 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.100956  normal  0.0832884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03292  outer membrane lipoprotein; lipocalin  30.52 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.658699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3483  Lipocalin family protein  29.93 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.662911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3186  Lipocalin family protein  30.5 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.982283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7080  Lipocalin family protein  28.66 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2028  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  27.86 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000105317  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5827  Lipocalin family protein  28.75 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0197  putative outer membrane lipoprotein  28.86 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6584  lipocalin-like protein  29.68 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1882  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  28.78 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04134  outer membrane lipoprotein  25.73 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1894  putative outer membrane lipoprotein, lipocalin Blc like  26.39 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.930658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3940  outer membrane lipoprotein Blc  29.22 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4736  outer membrane lipoprotein Blc  30.58 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4700  outer membrane lipoprotein Blc  30.58 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4617  outer membrane lipoprotein Blc  30.58 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4757  outer membrane lipoprotein Blc  30.58 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.860514  normal  0.568904 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4609  outer membrane lipoprotein Blc  30.58 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.700739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2446  Lipocalin family protein  29.75 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0478964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3509  Lipocalin family protein  31.68 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000208432  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5543  Lipocalin family protein  25 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.472799  normal  0.93837 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0084  outer membrane lipoprotein Blc  27.94 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.135556 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0091  outer membrane lipoprotein Blc  27.94 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0588419 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0580  Lipocalin-like  27.78 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4680  outer membrane lipoprotein Blc  28.93 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05664  lipocalin  28.85 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0065  outer membrane lipoprotein Blc  26.87 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0511  Lipocalin family protein  25.85 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0052  Lipocalin family protein  26.83 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1603  Lipocalin family protein  31.39 
 
 		 221 aa  61.2  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000130853  hitchhiker  0.0000767518 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3762  outer membrane lipoprotein Blc  28.95 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04021  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  28.1 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3841  Lipocalin family protein  28.1 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03983  hypothetical protein  28.1 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1741  Lipocalin family protein  26.87 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000602906  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5666  outer membrane lipoprotein Blc  28.1 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0769879 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0378  Lipocalin family protein  28.36 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4393  outer membrane lipoprotein Blc  28.1 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4707  outer membrane lipoprotein Blc  28.1 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3861  outer membrane lipoprotein Blc  28.1 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4619  outer membrane lipoprotein Blc  28.1 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0042  Lipocalin family protein  25 
 
 		 182 aa  60.1  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.724852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2381  lipocalin-like protein  23.78 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0865  Lipocalin family protein  24.11 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.85479  hitchhiker  0.00294878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0338  outer membrane lipoprotein Blc  25.74 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000224655 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0021  Lipocalin family protein  28 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5337  Lipocalin family protein  26.32 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1083  Lipocalin family protein  27.67 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.347255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1685  Lipocalin-like  25.75 
 
 		 368 aa  57  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1313  Lipocalin family protein  25.49 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2953  Lipocalin family protein  27.56 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01521  hypothetical protein  25.32 
 
 		 147 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.492304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3556  Lipocalin family protein  27.11 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000042  lipoprotein Blc  24.84 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1238  Lipocalin family protein  25.16 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01527  putative lipoprotein  25.16 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1788  Lipocalin family protein  30.53 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0188569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67450  outer membrane lipoprotein Blc  22.86 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4032  outer membrane lipoprotein Blc, putative  22.52 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2187  Lipocalin-like  25.79 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.8223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1806  Lipocalin family protein  22.52 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1457  Lipocalin family protein  25.62 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.725495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2775  Lipocalin family protein  25.97 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.267507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1840  Lipocalin family protein  24.22 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716092  normal  0.0523749 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2173  lipoprotein Blc  29.41 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.057952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0368  lipoprotein Blc  27.21 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1196  outer membrane lipoprotein  23.81 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5840  outer membrane lipoprotein Blc  23.2 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00681  lipoprotein Blc  25.16 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3632  Lipocalin family protein  22.52 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2844  Lipocalin family protein  27.88 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502473 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1532  putative homolog of BLC protein  29.77 
 
 		 149 aa  52.8  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1507  Lipocalin family protein  27.88 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3085  Lipocalin family protein  26.76 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0369  Lipocalin family protein  23.49 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2134  Lipocalin family protein  25.53 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0834445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1501  Lipocalin family protein  27.88 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0547186  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1537  Lipocalin family protein  27.88 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1344  Lipocalin family protein  25 
 
 		 161 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.861472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3785  lipocalin-like protein  24.38 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  decreased coverage  0.000240027 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1202  Lipocalin family protein  28.68 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3826  Lipocalin-like  22.52 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1410  Lipocalin family protein  25 
 
 		 171 aa  52  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607082  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1644  Lipocalin family protein  23.44 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5037  outer membrane lipoprotein Blc, putative  25.18 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5170  lipoprotein Blc  26.47 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4911  Lipocalin family protein  25.18 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0414  outer membrane lipoprotein (lipocalin)  30 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.103444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1786  lipoprotein Blc  25.19 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5087  Lipocalin family protein  25.9 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.884391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0427  Lipocalin family protein  24.82 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.861168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0342  putative Blc-like protein  30.08 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.305313  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4922  Lipocalin family protein  24.54 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2977  Lipocalin family protein  26.42 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4300  Lipocalin family protein  21.12 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0951  Lipocalin-like protein  25.78 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.795849 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>