226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2268 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  740    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  54.35 
 
 		 341 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  49.44 
 
 		 330 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  50.55 
 
 		 338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  50.81 
 
 		 349 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  50 
 
 		 338 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  50 
 
 		 338 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  49.73 
 
 		 338 aa  332  8e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  47.53 
 
 		 338 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  49.73 
 
 		 337 aa  328  7e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  49.45 
 
 		 337 aa  328  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  49.32 
 
 		 337 aa  322  5e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.08 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  46.89 
 
 		 347 aa  296  5e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  37.43 
 
 		 348 aa  223  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.68 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  34.24 
 
 		 334 aa  195  8.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.98 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  31.45 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  31.82 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  32.11 
 
 		 332 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  33.98 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  30.02 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  29.77 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  29.21 
 
 		 400 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  31.01 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  28.26 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  27.45 
 
 		 449 aa  114  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  28.12 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  26.29 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  28.15 
 
 		 372 aa  106  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  27.27 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  28.92 
 
 		 353 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  27.95 
 
 		 395 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  30.06 
 
 		 370 aa  97.8  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  29.06 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  26.05 
 
 		 356 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  26.45 
 
 		 367 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  27.35 
 
 		 398 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  27.07 
 
 		 386 aa  86.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  29.64 
 
 		 385 aa  85.9  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.98 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  26.98 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  26.98 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  27.57 
 
 		 339 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  26.39 
 
 		 453 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  27.51 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  25.86 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  25.99 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  26.29 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  26.57 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  27.57 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  26.04 
 
 		 346 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  25.72 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  25.5 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  25.78 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  27.02 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  25.8 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  28.69 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  25.35 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  28.86 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  25.42 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  27.06 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  26.59 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  26.46 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  28.81 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  27.11 
 
 		 342 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  26.18 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  26.18 
 
 		 341 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  26.59 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  25.93 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  26.1 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  26.1 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  24.35 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  25.3 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  25.6 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  25.21 
 
 		 323 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  26.32 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  27.11 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  26.18 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  25.73 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  24.86 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  26.05 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  27.27 
 
 		 357 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  27.3 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  25.91 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  24.52 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  25.81 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  26.05 
 
 		 334 aa  67  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  27.79 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  25.56 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  26.86 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  24.66 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  25.92 
 
 		 323 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  25.62 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  24.86 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>