259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1261 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  694    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  34.3 
 
 
372 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  33.43 
 
 
332 aa  156  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  30.65 
 
 
372 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  31.23 
 
 
348 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  27.81 
 
 
400 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  26.82 
 
 
379 aa  145  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  30.52 
 
 
385 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  35.06 
 
 
370 aa  144  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  31.95 
 
 
397 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  31.59 
 
 
389 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  31.66 
 
 
366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  31.38 
 
 
365 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  29.66 
 
 
330 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  31.87 
 
 
385 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  34.07 
 
 
353 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  30.75 
 
 
395 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  25.78 
 
 
347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  30.61 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  30.56 
 
 
385 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  28.05 
 
 
338 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  31.44 
 
 
390 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  29.29 
 
 
347 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  28.05 
 
 
338 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.61 
 
 
368 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  29.77 
 
 
374 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  31.81 
 
 
395 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  29.63 
 
 
357 aa  123  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  29.86 
 
 
373 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  27.74 
 
 
338 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  27.68 
 
 
338 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  28.53 
 
 
356 aa  122  7e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  27.16 
 
 
449 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  31.51 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  26.57 
 
 
367 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  26.1 
 
 
334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  31.88 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  28.46 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  28.46 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  28.46 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  27.09 
 
 
386 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  28.96 
 
 
349 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  30.38 
 
 
368 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  27.76 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  32.92 
 
 
323 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  27.69 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  28.14 
 
 
440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  30.59 
 
 
402 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  28.26 
 
 
365 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  29.48 
 
 
382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.22 
 
 
330 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  26.32 
 
 
338 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  30.28 
 
 
369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  31.29 
 
 
342 aa  112  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  28.61 
 
 
341 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  26.75 
 
 
337 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  32.85 
 
 
381 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  31.68 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  29.65 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  31.27 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  26.75 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  28.75 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  28.45 
 
 
363 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  28.06 
 
 
373 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  26.4 
 
 
337 aa  107  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  29.05 
 
 
362 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  29.08 
 
 
375 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  28.57 
 
 
346 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  32.3 
 
 
323 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  31.03 
 
 
376 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  28.69 
 
 
433 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  28.87 
 
 
398 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  26.63 
 
 
353 aa  103  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  31.48 
 
 
389 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  28.65 
 
 
370 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  29.81 
 
 
329 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  28.41 
 
 
380 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  29.7 
 
 
340 aa  99.4  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  28.37 
 
 
372 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  28.66 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  25.07 
 
 
398 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  34.48 
 
 
483 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  29.05 
 
 
339 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.22 
 
 
249 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.05 
 
 
341 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  29.56 
 
 
315 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  29.66 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  28.88 
 
 
341 aa  93.2  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  27.62 
 
 
389 aa  93.2  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  29.66 
 
 
343 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  29.36 
 
 
338 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.75 
 
 
341 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  28.35 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  28.53 
 
 
340 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.88 
 
 
384 aa  91.7  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  36.88 
 
 
425 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  29.45 
 
 
369 aa  90.1  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  27.73 
 
 
306 aa  89.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  35.84 
 
 
244 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  27.63 
 
 
325 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>