224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2952 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  703    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  54.35 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  56.3 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  56.3 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  56.01 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  56.3 
 
 		 338 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  54.55 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  54.55 
 
 		 337 aa  362  6e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  54.55 
 
 		 337 aa  358  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  54.25 
 
 		 337 aa  358  7e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  52.55 
 
 		 330 aa  352  4e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  53.37 
 
 		 337 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  51.45 
 
 		 349 aa  346  4e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  47.95 
 
 		 338 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  48.07 
 
 		 347 aa  315  6e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  39.43 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  37.46 
 
 		 334 aa  222  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  37.32 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  36.76 
 
 		 330 aa  208  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  30.3 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  33.13 
 
 		 332 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  29.29 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  27.49 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  33.33 
 
 		 402 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  29.91 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  27.98 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  31.78 
 
 		 382 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  29.86 
 
 		 395 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  26.8 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  28.61 
 
 		 341 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  27.67 
 
 		 440 aa  109  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  27.17 
 
 		 386 aa  109  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1990  protein of unknown function DUF182  29.15 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  27.86 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  27.18 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  27.3 
 
 		 331 aa  100  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  26.19 
 
 		 365 aa  99.8  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  27.99 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.97 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  28.97 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  28.97 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  28.93 
 
 		 315 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  27.1 
 
 		 340 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  27.59 
 
 		 342 aa  93.6  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  29.6 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  29.6 
 
 		 343 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  28.04 
 
 		 340 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  28.66 
 
 		 453 aa  92.4  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  92.4  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  25.07 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  27.33 
 
 		 342 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  28.3 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  28.3 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  25 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  23.2 
 
 		 373 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  28.3 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  25.3 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  27.62 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  28.3 
 
 		 341 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  28.3 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  27.49 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  24.33 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  26.91 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  25.14 
 
 		 385 aa  82.8  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  26.33 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  24.47 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  26.63 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  24.62 
 
 		 339 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  26.62 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  28.96 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  28.44 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  25.62 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  25 
 
 		 325 aa  78.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  25.55 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  27.24 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  27.36 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  24.79 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  24.72 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  27.36 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  24.26 
 
 		 323 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  26.7 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  26.71 
 
 		 345 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  23.96 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  24.18 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  25.31 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  26.3 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  26.56 
 
 		 333 aa  76.3  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  25.8 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  24.78 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  24.56 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  33.33 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  24.67 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  24.67 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  24.67 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  22.51 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  22.88 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  27.53 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  25.23 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  23.78 
 
 		 385 aa  73.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>