More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13100 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  100 
 
 		 374 aa  739    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  74.25 
 
 		 368 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  68.9 
 
 		 373 aa  505  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  68.63 
 
 		 386 aa  502  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  68.9 
 
 		 386 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  69.57 
 
 		 398 aa  501  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  68.9 
 
 		 386 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  68.83 
 
 		 385 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  66.76 
 
 		 373 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  70.08 
 
 		 380 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  66.13 
 
 		 366 aa  461  1e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  64.15 
 
 		 368 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  63.81 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  69.53 
 
 		 363 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  63.69 
 
 		 369 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  65.69 
 
 		 385 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  62.17 
 
 		 397 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  61.87 
 
 		 386 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  65.85 
 
 		 389 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  62.97 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  53.28 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  54.06 
 
 		 372 aa  352  4e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  50.95 
 
 		 381 aa  309  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  51.41 
 
 		 385 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  48.36 
 
 		 357 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  42.9 
 
 		 367 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  50.13 
 
 		 370 aa  287  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  57.48 
 
 		 266 aa  262  8e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  52.88 
 
 		 483 aa  255  8e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  44.7 
 
 		 421 aa  255  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  42.2 
 
 		 375 aa  242  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  41.32 
 
 		 433 aa  242  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  41.3 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  38.95 
 
 		 356 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  43.42 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  43.13 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  40.33 
 
 		 369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  38.07 
 
 		 323 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  39 
 
 		 342 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  37.25 
 
 		 329 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  36.81 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  38.4 
 
 		 318 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  36.1 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  36.18 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  36.54 
 
 		 388 aa  179  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  39.47 
 
 		 316 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.32 
 
 		 244 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  35.69 
 
 		 323 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  35.41 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  33.88 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  39.51 
 
 		 240 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  31.75 
 
 		 372 aa  162  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  37.72 
 
 		 306 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  39.83 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  34.25 
 
 		 340 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  37.43 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  34.92 
 
 		 356 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  35.91 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  32.12 
 
 		 400 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.49 
 
 		 340 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  30.93 
 
 		 372 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  32.32 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  27.78 
 
 		 379 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  33.62 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  49.04 
 
 		 225 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  33.61 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  29.49 
 
 		 386 aa  149  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  30.11 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  34.52 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  36.16 
 
 		 313 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  35.21 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  34.26 
 
 		 453 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  33.14 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  28.31 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  33.14 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  31.88 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  33.43 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  33.43 
 
 		 315 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  33.43 
 
 		 338 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.43 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  32.23 
 
 		 341 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  40.71 
 
 		 242 aa  143  6e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  33.43 
 
 		 341 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  33.43 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  33.43 
 
 		 343 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  31.04 
 
 		 346 aa  142  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  34.18 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  47.31 
 
 		 338 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  32.05 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.58 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.1872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  42.29 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.78 
 
 		 243 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  32.4 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  31.12 
 
 		 332 aa  139  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  32.4 
 
 		 343 aa  139  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  33.71 
 
 		 337 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  31.5 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  31.15 
 
 		 376 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  33.52 
 
 		 334 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  48.48 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>