289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2480 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  100 
 
 
402 aa  803    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  57.44 
 
 
395 aa  388  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  52.07 
 
 
382 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  40.82 
 
 
440 aa  256  4e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  39.47 
 
 
449 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  39.38 
 
 
385 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  35.43 
 
 
379 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  36.03 
 
 
386 aa  224  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  41.05 
 
 
395 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  35.03 
 
 
400 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  35.36 
 
 
372 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  36.02 
 
 
389 aa  194  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  36.97 
 
 
332 aa  186  7e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  35.46 
 
 
365 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  37.43 
 
 
370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  32.08 
 
 
348 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  35.01 
 
 
372 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  31.13 
 
 
347 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  34.2 
 
 
386 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  30.15 
 
 
367 aa  150  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  34.97 
 
 
357 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  34.2 
 
 
368 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  35.25 
 
 
356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  33.25 
 
 
385 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  31.39 
 
 
398 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  30.55 
 
 
330 aa  140  6e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  33.42 
 
 
369 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.23 
 
 
353 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  32.82 
 
 
386 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  32.82 
 
 
386 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  32.56 
 
 
386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  31.64 
 
 
349 aa  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  34.66 
 
 
375 aa  137  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  34.92 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  34.51 
 
 
381 aa  135  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  33.25 
 
 
366 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  31.82 
 
 
365 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  32.49 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  31.93 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  32.28 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  31.77 
 
 
372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  32.38 
 
 
374 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  33.5 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  35.89 
 
 
368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  31.52 
 
 
385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  29.62 
 
 
346 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  38.11 
 
 
248 aa  126  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  30.79 
 
 
334 aa  126  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  32.37 
 
 
337 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  32 
 
 
338 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  36.19 
 
 
244 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  31.52 
 
 
338 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  32 
 
 
338 aa  123  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  31.07 
 
 
338 aa  123  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  31.5 
 
 
337 aa  122  9e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  33.33 
 
 
341 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  31.71 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1437  hypothetical protein  30.9 
 
 
337 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1502  hypothetical protein  30.9 
 
 
337 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  30.81 
 
 
372 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  31.86 
 
 
388 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  31.49 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  29.78 
 
 
338 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  31.69 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  30.59 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  30.32 
 
 
425 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  29.67 
 
 
330 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  32.46 
 
 
389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  33.67 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  32.19 
 
 
389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  30.33 
 
 
341 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  27.69 
 
 
344 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  32.11 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  32.01 
 
 
385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  29.3 
 
 
278 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  27.86 
 
 
376 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  31.37 
 
 
363 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  31.91 
 
 
360 aa  106  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  31.48 
 
 
306 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2211  protein of unknown function DUF182  28.14 
 
 
265 aa  106  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000212868  normal  0.0832425 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  33.66 
 
 
421 aa  106  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  28.95 
 
 
323 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  31.81 
 
 
306 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3433  protein of unknown function DUF182  27.08 
 
 
354 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  31.41 
 
 
376 aa  104  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  33.07 
 
 
380 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  30.17 
 
 
398 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  30.23 
 
 
329 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1468  protein of unknown function DUF182  27.5 
 
 
345 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  31.91 
 
 
281 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  29.17 
 
 
351 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  30.56 
 
 
331 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  28.74 
 
 
269 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  31.6 
 
 
266 aa  101  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1138  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  28.52 
 
 
384 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  25.34 
 
 
354 aa  99  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2006  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  29.15 
 
 
249 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.88376  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  31.01 
 
 
340 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1485  hypothetical protein  32.66 
 
 
374 aa  95.5  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.682746  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  27.3 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>